Злобно взглянув на Туполева, Берия отправил его на сутки в одиночную камеру. Когда его снова привели к Берии, тот объявил, что он со Сталиным приняли решение: срочно делать двухмоторный, а после него четырехмоторный. Затем он спросил Туполева о характеристиках двухмоторного АНТ-58 и приказал увеличить скорость с 600 до 700 км/ч, дальность с 2 тыс. км до 3 тыс. км и бомбовую нагрузку с трех до четырех тонн. Приказал генералу Давыдову поручить военным составить требования к двухмоторному пикирующему бомбардировщику с учетом его, Берии, указаний.
Длительный период согласования требований к пикирующему фронтовому бомбардировщику Туполева был вызван техническими амбициями Берии, которого боялись как летчики, так и конструкторы и который узурпировал положение блюстителя высших государственных интересов.
Затем переезд группы Туполева в ЦКБ-29, которое уже работало над машинами Петлякова и Мясищева.
К марту 1940 года организуется новый СТО-3 для проектирования двухмоторного фронтового пикирующего бомбардировщика по предложению Туполева. Руководителем назначается майор НКВД Балашов. Его заместителем — майор НКВД Крючков. Главным конструктором проекта «103» назначают заключенного Туполева.
К тому времени начальника всех «шараг» генерала НКВД Давыдова посадили и на его место назначили генерала Кравченко. К нему-то и обратился Туполев с требованием предоставить доказательство, что его жена и дети живы, и предложил в качестве такого доказательства передачу ему записки от жены Юлии Николаевны. В противном случае он от работы отказывается. Записку организовали. Она была написана арестованной в одно время с ним Юлией Николаевной в тюрьме под диктовку.
В команду А.Н. Туполева вошли зэки:
Н. И Базенков — заместитель, С М Егер — общие виды и компоновка, А.Э. Стерлин — аэродинамика, А.М. Черемухин — прочность, Н.А. Соколов — аэроупругость и вибрации, А И. Некрасов — теоретические расчеты, С П. Королев, которого потом заменил Б.А Саукке, — крыло, В.А. Чижевский — центроплан, И.Г. Неман — фюзеляж, Д С. Марков — оперение и система управления, Т.П Сапрыкин — шасси, М Н. Петров — гермокабины и кондиционирование, А.Р. Бонин — гидросистема, Л.Л Кербер — радио- и электрооборудование, Г.С. Френкель — приборное оборудование, А В. Недашкевич — вооружение, С.А. Викдорчик — технология сборки, Г.А. Озеров — административно-хозяйственное обеспечение. Два вольнонаемных инженера А.П Балуев и Б.С. Иванов руководили бригадами установки двигателей и их оборудования.
Такие специалисты высочайшего класса, как А.М. Черемухин, А.Э. Стерлин, А.И. Некрасов, М.Н. Петров, Т.П. Сапрыкин и А.В. Недашкевич, продолжая доводку проектов «100» Петлякова и «102» Мясищева, переключились на разработку проекта «103» Туполева.