Первым, от кого решили избавиться, и был «слишком активный» Юрий Шутов, которого незамедлительно решили уволить, как только «игра пошла по-крупному».
Формальным поводом для его отставки послужил подписанный им заведомо невыполнимый контракт с одним английским бизнесменом-банкротом, которого рассматривали в качестве инвестора проекта по созданию Ленинградской свободной экономической зоны. Хотя сам Юрий Титович в написанной им книге воспоминаний указывает совершенно другие причины отставки, а именно свои принципиальные разногласия с Собчаком в морально-этическом и даже политическом плане, что и сейчас выглядит крайне неубедительно: учитывая жизненный опыт Шутова, сложно поверить в то, что он когда-то испытывал наивные иллюзии насчёт морального облика тех, кто достигает вершин власти, и находился в плену романтических представлений о сути происходивших тогда политических процессов.
Получив отставку, Юрий Шутов с головой погрузился в «бандитский Петербург» и уже в начале 1992 года был арестован в составе целой банды, которая занималась вымогательствами и решала «деликатные вопросы», как это принято говорить, в спорах хозяйствующих субъектов. Впрочем, потом его отпустили под подписку о невыезде, а в 1996 году и вовсе оправдали «за недостаточностью улик»: надо полагать, что такой «продуманный» человек, как Шутов, не действовал на свой страх и риск, а «работал» под надёжным прикрытием чекистов, потому и отделался лёгким испугом.
Как и в прошлый раз, миновав судимость, Юрий Шутов – как можно догадаться, не без помощи своих покровителей из Конторы – занимает очередную весьма влиятельную должность, а именно становится руководителем Рабочей группы по г. Санкт-Петербургу и Ленинградской области, созданной при Госдуме по инициативе КПРФ и ЛДПР временной Комиссии по анализу итогов приватизации 1992–1996 гг. и ответственности должностных лиц за их негативные результаты.
Тогда территориальные подразделения этой Комиссии действовали во многих регионах России: под прикрытием популистского лозунга оппозиции о пересмотре итогов «чубайсовской приватизации», по существу, со стороны окрепших силовых структур, которые в своё время оказались обделёнными и теперь претендовали на свой кусок «пирога», предпринимались попытки перераспределения собственности. И Шутов в роли «наводчика» этой Комиссии в городе на Неве для чекистов был незаменимым человеком.
Столкновение бизнес-интересов «силовиков» и участие в этих разборках Шутова в конце концов привели к гибели вице-губернатора Санкт-Петербурга Михаила Маневича, который одновременно являлся председателем городского Комитета по управлению городским имуществом. Маневич занимался вопросами приватизации госсобственности в северной столице ещё с 1992 года, работая под началом Анатолия Чубайса в команде мэра Собчака.