Там уже видели в комкоре Миронове "замаскировавшегося врага". Не завершив формирования корпуса, Миронов, вопреки приказу РВС Южного фронта, самовольно отправляется с казаками на фронт против Деникина. В своих воззваниях Миронов заявлял, что он выступает "на жестокую борьбу с Деникиным и буржуазией", призывал русский народ взять "всю власть, всю землю, фабрики и заводы в свои руки". "Долой самодержавие, комиссаров и бюрократизм коммунистов, погубивших революцию…"
[92] — говорилось в одном из воззваний. Это было расценено как контрреволюционное самоуправство с целью "поднять восстание против Советской власти". В сентябре 1919 года Миронова арестовали и по приказу Троцкого, переданному Смилге, предали военному трибуналу
[93]. Еще до задержания, "мятежника" Троцкий в своем поезде выпустил листовку, озаглавленную "Полковник Миронов". В ней Предреввоенсовета признавал, что "при продвижении красных войск на Дон были несомненно совершены в разных местах отдельными советскими представителями и худшими красноармейскими частями несправедливости и даже жестокости по отношению к местному казацкому населению". Однако далее Троцкий обвиняет Миронова в попытке стать "Донским наказным атаманом", а пока, мол, "Миронов помогает Деникину". Последние две строки написаны типичным языком гражданской войны: "В могилу Миронова история вобьет осиновый кол, как заслуженный памятник презренному авантюристу и жалкому изменнику"
[94]. Здесь Троцкий явно перестарался.
В начале октября 1919 года военный трибунал приговорил Миронова и его товарищей к расстрелу. Однако Политбюро ЦК РКП(б) 23 октября 1919 года отменило приговор. А почти через десять месяцев, в сентябре 1920 года, бывший смертник назначается командующим 2-й Конной армией, которая отличилась при разгроме Врангеля. 25 ноября 1920 года Ф.К.Миронов награждается высшей боевой наградой того времени — Почетным революционным оружием (шашкой с вызолоченным эфесом и орденом Красного Знамени). Получив в январе 1921 года предложение на новое назначение — главным инспектором кавалерии РККА, Миронов отправился в Москву. Кстати, награждение Миронова Почетным революционным оружием и назначение его на высокий пост в кавалерии, на который претендовал Буденный и который он занял позднее, свидетельствует о том, что Троцкий менял свое отношение к Миронову в лучшую сторону.
Однако было известно, что в публичных разговорах Ф.К.Миронов не "жаловал" Троцкого, выражая ему недоверие. Некий Бакунин написал на командарма донос, вновь инкриминируя ему замыслы поднять восстание на Дону. 13 февраля 1921 года Миронов был опять арестован и препровожден в Бутырскую тюрьму. Прославленный командир пишет из камеры письма, требует справедливого разбирательства и освобождения. В письмах несколько раз в не лучших выражениях упоминается Троцкий. Все остается без ответа. Тогда командарм пишет еще одно письмо: