Маршал Василевский планировал штурм Кенигсберга. К нему необходимо было тщательно подготовиться. Гитлеровцы превратили город в мощную крепость. Работы по его укреплению велись в течение всего периода окружения до последнего дня. По приказу Коха в черте города был оборудован специальный аэродром. Гарнизон Кенигсберга состоял более чем из ста тысяч солдат и двух тысяч офицеров, имевших в своём распоряжении тысячи орудий и танков и другие виды вооружения. Комендантом кенигсбергской крепости был генерал Лаш.
Гауляйтер Кох до последнего дня находился на территории Пруссии. Пользуясь специальным разведывательным самолётом, он постоянно поддерживал непосредственную связь с остатками войск на узкой полоске Балтийской косы. Узнав в начале советского наступления о самовольном отходе Госбаха с рубежей обороны в районе Голдапа, он не преминул тотчас же информировать об этом Гитлера и стал домогаться наказания генерала. Он лично уверял фюрера, что находящиеся на Самбийском. полуострове и Балтийской косе немцы отобьют все атаки Красной Армии и даже перейдут отсюда в контрнаступление. Когда, однако, положение на этом участке стало совсем трагическим, Кох потихоньку, ночью, отправился на заранее приготовленном ледоколе с Балтийской косы в Данию.
Штаб маршала Василевского завершал последние приготовления к штурму Кенигсберга. На очень подробном макете города офицеры знакомились с расположением улиц, площадей, изучали форты и другие оборонительные сооружения крепости, которую вскоре предстояло брать. Формировались специальные штурмовые группы, в состав которых вошли пехотинцы, танкисты, артиллеристы и сапёры. К городу были стянуты тысячи орудий. Апрельский ветер и весеннее солнце подсушили раскисшую землю. Сама природа создавала благоприятные условия для штурма.
6 апреля войска двинулись на Кенигсберг. Части армии генерала Людникова отрезали Кенигсберг от Самбийского полуострова и порта Пиллау. С юга и запада город атаковали войска генералов Галицкого и Белобородова. Танки крушили систему обороны немцев. На город обрушилась лавина артиллерийского огня и авиабомб — он пылал. Последним днём битвы за Кенигсберг было 9 апреля. Остаткам гарнизона, ещё продолжавшим сопротивление, маршал Василевский предъявил ультиматум. По городской радиосети генерал Лаш объявил о капитуляции. Девяносто две тысячи немцев сложили оружие, и среди них — значительное количество офицеров и генералов. Морская крепость Пиллау пала 25 апреля. Балтийская коса, где скопились остатки «непобедимых» гитлеровских армий и тысячи гражданских беженцев, капитулировала 9 мая 1945 года.