1644–1645 — дело «королевича Вальдемара».
1645, 13 июля — смерть царя Михаила Федоровича. Вступление Алексея Михайловича на русский престол.
28 сентября — венчание Алексея Михайловича на царство.
1646–1648 — правительство боярина Б. И. Морозова.
1646 — составление переписных книг.
Появление в Москве будущего патриарха Никона. Его знакомство с Алексеем Михайловичем и назначение архимандритом Новоспасского монастыря.
1648, январь — женитьба Алексея Михайловича на Марии Ильиничне Милославской.
Июнь — восстание в Москве, падение правительства Б. И. Морозова.
1648, сентябрь — 1649, январь — составление Земским собором и Уложенной комиссией Н. И. Одоевского нового Уложения. Участие Алексея Михайловича в работе собора. Принятие Соборного уложения 1649 г.
1648, октябрь — возвращение боярина Б. И. Морозова из ссылки в Москву.
1649, январь — столкновение протопопа Стефана Вонифатьева с патриархом Иосифом по вопросу единогласия на церковном соборе. Поддержка царем протопопа. Избрание Никона новгородским митрополитом.
1650 — восстание во Пскове и Новгороде.
1652, апрель — смерть патриарха Иосифа.
Июль — избрание патриархом Никона.
1653, весна — начало проведения церковных реформ патриархом Никоном.
1 октября — решение Земского собора о принятии Украины в русское подданство.
Около 1654 — возникновение приказа Тайных дел.
1654–1667 — русско-польская война.
1654, январь — Переяславская рада, принявшая решение о вхождении Украины в состав Московского государства.
1654 — первый поход Алексея Михайловича против Речи Посполитой. Участие в осаде и взятии Смоленска.
1654, лето — зима — чума в Москве.
1655 — второй поход Алексея Михайловича против Речи Посполитой.
1656–1658 — русско-шведская война.
1656 — участие Алексея Михайловича в осаде Риги.
Ноябрь — перемирие с Речью Посполитой.
1658 — разрыв Алексея Михайловича и Никона. Удаление Никона в Новоиерусалимский Воскресенский монастырь.
Октябрь — возобновление русско-польской войны.
Декабрь — Валиесарское перемирие со Швецией.
1659, июль — поражение русских войск под Конотопом.
Август — поражение гетмана Выговского и его свержение.
1661 — Кардисский мир со Швецией.
30 мая — рождение царевича Федора Алексеевича.
1662, 25 июля — «Медный бунт».
1666–1667 — участие Алексея Михайловича в работе церковного собора. Суд и низложение Никона. Соборное осуждение старообрядцев. Начало раскола.
1666, 27 июля — рождение царевича Ивана Алексеевича.
1667, январь — заключение Андрусовского перемирия с Речью Посполитой.
1669, 4 марта — смерть царицы Марии Ильиничны.
1670, 17 января