Киликийское Армянское царство с 1375 года по начало XVI в. управлялось султанскими наместниками, находившимися в его главных городах.
Верховным правителем мамлюкского султаната номинально считался халиф — эмир правоверных. Он придавал видимость законности власти мамлюкских султанов. Тагри Бирди в своем труде пишет имя халифа перед именем султана. Его основной обязанностью было официальное введение в должность султана, что выражалось в жаловании ему диплома на управление делами мусульман. Халиф размещался в собственных апартаментах, дарованных ему султаном, внутри каирской цитадели. Многие халифы обладали определенным личным влиянием, но никаких реальных рычагов власти у них не было. Хитти называет последних аббасидских халифов марионетками мамлюкских султанов и с этим заключением нельзя не согласиться.
После разорения Багдада внуком Чингиз — хана Хулагу в 1258 году рухнул Аббасидский халифат. Но часть халифского семейства сумела избежать резни и обосновалась в Дамаске. Мамлюкский султан Бибарс ал — Бундукдари в июне 1261 года пригласил оттуда дядю последнего халифа — сына халифа аз — Захира, правившего ранее. Он встретил его с большим почетом как нового халифа ал — Мустансира. После проверки его происхождения на совете высших религиозных авторитетов он даровал Бибарсу власть над Египтом, Сирией, Дийарбекром, Хиджазом, Йеменом и землей Евфрата. Через три месяца Бибарс понял, что имеет дело с глупым, но при этом чрезвычайно властолюбивым человеком и потому решил избавиться от него. Он объявил о своем намерении восстановить власть халифа в Багдаде и выступил с войском из Каира. Но по достижении Дамаска оставил халифа на произвол судьбы: ал — Мустансир с небольшим отрядом отправился в Багдад и погиб где‑то в пустыне от монгольской сабли.
Через год Бибарс сделал халифом еще одного отпрыска Аббасидского дома. Новый ставленник по имени ал — Хаким оказался понятливее своего незадачливого предшественника и никогда не вмешивался в дела мамлюкской верхушки. Его потомки были халифами до завоевания Египта Селимом Явузом. В 1412 году после смерти сына Баркука ан — Насир Насир ад — дина Фараджа на престол был возведен одной из мамлюкских клик халиф ал — Адил ал — Мустаин, но уже через несколько дней он был смещен ал — Муаййад Шайхом (1412–1421). Последний халиф ал — Мутаваккиль был увезен Селимом в Стамбул, где и передал права на халифат османскому дому.
Мамлюкский султан несмотря на то, что фактически избирался на трон высшими эмирами, являлся абсолютным монархом. Он клялся служить верно интересам мамлюков, а те, в свою очередь, приносили присягу верности султану. Официально его вступление на трон освещалось халифской инвеститурой. При султане имелся совещательный орган, состоявший из опытных эмиров сотни. Самый старший, как правило, возглавлял совещание. Правление султана начиналось с того момента как он облачался в султанскую мантию. Он назначал и смещал по своей воле всех сановников в государстве, а также халифа; командовал армией в важнейших кампаниях, подписывал указы и являлся высшей судебной инстанцией.