При устройстве прудов Андрей Тимофеевич принимал во внимание как внешние обстоятельства, так и биологические особенности рыб. Он учитывал характер водоснабжения пруда, возможность создания хорошего дна. Ученый также обращал внимание на укрепление берегов, получение необходимой глубины водоема, устройство удобного водоспуска. Андрей Тимофеевич подчеркивал необходимость создания благоприятных условий для нереста рыб и заключительного периода их содержания - быстрого и продуктивного нагула. Учитывая биологические особенности прудов, Болотов делил их на три группы (соответствующие современным нерестовым, выростным и нагульным прудам).
Придавая большое значение созданию благоприятных условий для нереста рыб, Болотов писал: «Далее из опытности замечу, что чем более в верхнем конце пруда будет мелкого места, тем лучше; ибо многие роды рыб, особливо же карпии, никак не мечут икры в глубине, а ищут к тому самых мелких и таких мест, где бы вода могла быть согреваема солнцем и действие лучей оного достигало бы до самого дна. Особенно для рыбы, хорошо, если в сих мелких местах, подле берегов, накидан будет, кое где хворост, который рыбе для метания икры очень нужен».
Андрей Тимофеевич также обращал внимание рыбоводов на необходимость учета возрастных особенностей рыб. В статье «О карпиях» он писал: «При сажании в сии пруды надлежит их (карпов) прилежно разбирать то есть на три руки больших, средних и самых малых, и каждые из них сажать в особые пруды, на один, два или на три года, потому что вместе всех их сажать не годится, по причине, что они вырастать будут не все вдруг, следовательно не могут всем разом вылавливаемы быть, ибо меньшие тогда еще будут вырастать, когда большие начнут икру кидать и плодиться, которой приплод называется бастартами, чем вся посадка повредится и получению пользы сделается остановка».
Болотов применял разнообразные приемы для интенсификации рыбоводства, в том числе уплотненные посадки рыбы, ее подкормку, садковое содержание, разведение в водоеме разных видов рыб.
Высказывая свои соображения о подготовке рыбы к отлову, он писал: «...сверх того, великая надобность и в том, чтобы для растения (роста) желаемые или так называемые садковые карпы, сажаемы были всегда в пруды, в которых бы дно было тучнее, вода теплее, нежели каковое дно и вода были в тех прудах, где они до того сидели, дабы лучше удавались и скорее вырастать могли».
Большое значение для эффективного нагула рыбы, по мнению Андрея Тимофеевича, имели достаток пищи и температура воды в прудах. Ученый подчеркивал, что в нагульных прудах воды должно быть столько, сколько необходимо для того, чтобы она хорошо прогревалась солнцем. Кроме того, он советовал периодически подкармливать рыбу.