Постоянные конфликты с главнокомандующим по вопросу «выравнивания линии фронта» отрицательно сказались на здоровье и основательно подорвали оптимизм начальника Генштаба. В итоге его хватил удар. В апреле 1944 г. Гитлер обвинил Цайтцлера в том, что он «поддался уговорам генералов» , после чего у того случился инсульт. Генерал был помещен в госпиталь, а его обязанности временно исполнял начальник оперативного отдела ОКХ генерал Хойзингер.
Тем временем дела на фронте шли все хуже и хуже. Немецкие войска эвакуировались из Крыма, Вермахт потерпел поражения в Прибалтике и на Днестре. В июле 1944 г. Цайтцлер в резкой форме потребовал вывести войска группы армий «Норд» из Прибалтики, пока они не были окружены там. Гитлер, естественно, отказался отдать подобный приказ, и между ними произошла шумная ссора. Наконец, 20 августа – через месяц после покушения в «Волчьем логове» – Цайтцлер был заменен генералом Хайнцем Гудерианом. Это назначение в период кризиса показывает, что Гитлер все же стремился назначать на ключевые должности профессионалов высокого класса, а не пресмыкающихся подхалимов. Заранее было ясно, что Гудериан не станет безголосым исполнителем.
Последнему было сразу же заявлено, что его функция состоит в простой трансляции приказов фюрера на Восточный фронт, подготовке ежедневных докладов и предложений по предлагаемым операциям. В это время начальник Генштаба, в отличие от начала войны, уже не обладал никакой реальной властью и мог только «советовать» фюреру. Тем не менее, будучи человеком крайне деятельным, Гудериан все же попытался укрепить свое положение путем кадровых перестановок. С одобрения нового начальника Управления кадров генерала Бургдорфа он решил доукомплектовать генеральный штаб фронтовыми офицерами. Первым заместителем стал генерал-танкист Вальтер Венк, а начальником оперативного отдела – также танкист оберст фон Бонин. Ряд других ключевых должностей тоже заняли бывшие соратники Гудериана.
Далее он издал два приказа, о которых, кстати, в своих мемуарах «забыл» упомянуть. В них нацистское руководство заверялось в неизменной верности офицерского корпуса фюреру и Рейху. Гудериан потребовал, чтобы все офицеры Генштаба являли собой образец нациста, верного и преданного Гитлеру. Таким образом, германский Генштаб окончательно потерял свою самостоятельность и отказался от исторических традиций. Как писал американский журналист Уильм Ширер: «Эта элитарная группа военного руководства, которая управляла Германией в Первую мировую войну, теперь, летом 1944 г., превратилась в жалкую кучку подобострастных и запуганных людей»