(их насчитывалось около 15 тыс.) никакие правовые ограничения в Российской империи не распространялись. Однако переход в караимство других евреев был запрещен.
После ликвидации кагальной системы продолжали существовать автономные религиозные еврейские общества, правда, они не имели определенного четкого юридического статуса. Раввины сначала избирались еврейскими обществами, а после издания специального закона в 1901 г. — уполномоченными прихожанами молитвенных домов. Избранные утверждались начальством губернии. Наряду с утвержденным «казенным» раввином существовал неформальный «духовный» раввин, которого все уважали за высокую ученость. В масштабах Империи существовал высший официальный орган для решения вопросов по религиозно-духовным делам евреев — «Раввинская комиссия», выполнявшая, в частности, консультативные функции при Министерстве внутренних дел.
В начале XX в. ведущими центрами религиозной жизни иудейских общин наряду с прежними в Одессе, Варшаве и Вильно становятся Санкт-Петербург и Москва, где сооружаются монументальные синагоги. Раввинами столичной Санкт-Петербургской синагоги были люди исключительной учености и высоких моральных качеств. Среди них можно назвать И. Ольшвангера, Д. Каценеленбойгена, А. Драбкина, М. Айзенштадта. В Москве много сделал для духовного развития еврейского населения города высокообразованный раввин 3. Минор, обучавший ивриту Л. Толстого. Печатались многочисленные издания религиозного характера на древнееврейском (иврите), идише и русском языках. Надо отметить, что в отличие от США среди евреев России не нашло отклика движение реформизма. Кроме того, перед лицом общего противника — атеизма — резко снизилась острота конфликта между хасидами и митнагдимами.
В последние годы существования империи, особенно после революции 1905 г., резко усилилась антиеврейская идеологическая кампания, кульминацией которой стало так называемое «дело Бейлиса». В 1911 г. скромного киевского мещанина Менделя Бейлиса обвинили в совершении ритуального убийства христианского мальчика. Несмотря на явные попытки правительственной юстиции осудить Бейлиса, решением присяжных он был оправдан. Следует отметить, что православное духовенство отрицало наветы об употреблении евреями христианской крови. Тем не менее анитисемитское и антииудейское «черносотенное» движение продолжало свою активную деятельность, идейно опираясь на сфабрикованные в недрах тайной полиции так называемые «Протоколы сионских мудрецов», якобы свидетельствующие о тайном заговоре еврейских богачей, направленном на то, чтобы захватить власть над всем миром.