Уголовно-исполнительная система включает в себя:
– учреждения, исполняющие наказания;
– следственные изоляторы;
– органы, исполняющие наказания без лишения свободы;
– предприятия, специально созданные для обеспечения деятельности УИС;
– научно-исследовательские, проектные, лечебные, учебные и иные учреждения;
– территориальные органы управления УИС;
– центральные органы управления УИС Министерства юстиции Российской Федерации.
Руководство системой было возложено на Главное управление исполнения наказаний Министерства юстиции РФ. В его структуру входило 19 управлений, охватывающих все стороны деятельности УИС. В связи с передачей УИС из ведения МВД в ведение Министерства юстиции (1 сентября 1998 г.) и расширением функций были созданы новые управления: конвоирования и спецперевозок, правовое, учебных заведений и научно-исследовательских учреждений, медицинское, по работе с личным составом, бухгалтерского учета, отчетности и ревизионной работы. Впервые за многие годы в центральный орган управления пришли доктора наук, известные ученые.
Повышение научного потенциала работников всех уровней (Федерального и субъектов в составе РФ) не замедлило сказаться на качестве изучения положения дел в системе органов и учреждений исполнения наказаний. Особенно заметны корректировки деятельности УИС
РФ в сторону гуманизации исполнения наказаний, сужение сферы лишения свободы за счет преобладания в колониях, тюрьмах, воспитательных колониях преимущественно лиц, осужденных за совершение тяжких и особо тяжких преступлений, и рецидивистов, в том числе особо опасных. Заметен акцент на расширение применения наказаний без изоляции от общества. К сожалению, многое из наработанного учеными и практиками УИС РФ не удается реализовать в связи с недофинансированием и явно неадекватной объему и сложности служебных обязанностей сотрудников УИС РФ оплатой труда.
ФСИН Минюста РФ продолжает работу по совершенствованию системы управления УИС; упорядочению структуры территориальных органов; расширению прав начальников территориальных органов в решении оргштатных вопросов; обеспечению и переподчинению управлений лесных исправительных учреждений соответствующим территориальным органам УИС в субъектах РФ.
Проведена работа по передаче начальникам территориальных органов прав на объявление и внесение изменений в штатное расписание подразделений по конвоированию, отделов специального назначения, подразделений оперативно-технических мероприятий, оперативно-розыскных бюро.
Подразделения розыска и подразделения «Б» (собственной безопасности) при территориальных органах УИС были объединены в одну структуру (оперативно-розыскное бюро). В основном сохранен кадровый потенциал УИС, порядок социально-бытового и медицинского обеспечения. Благодаря мерам, принятым Президентом и Правительством РФ, увеличилось денежное довольствие свыше 350 тыс. сотрудников и пенсионное обеспечение 29 тыс. пенсионеров УИС. Более того, из резервного фонда Президента РФ выделено 6,2 млн руб. для детских и женских исправительных учреждений.