В верховьях Дона главным городком считался «Усть-Медведицкий». Выше его старейшими городками можно называть «Вёшки» и «Мигулин».
В республике установилась древнейшая форма власти. Полнота ее в руках народного собрания, которое называлось так же – Круг. В перерывах между кругами управлял избранный атаман, власть исполнительная. Атаману, избранному единогласно, мазали голову грязью и сажей, сыпали за ворот горсть земли, как преступнику перед утоплением, показывая, что он не главарь, а слуга общества, и в случае чего его покарают беспощадно. Атаману избирали двух помощников, есаулов. Власть атаманская длилась один год, как у консула в Древнем Риме. Да и вся эта система власти напоминала Римскую республику времен ее расцвета.
По такому же принципу строилось управление в каждом городке.
Собираясь в набег или поход, так же избирали атамана и всех начальников, и до конца предприятия избранные вожди могли наказать за неповиновение смертью.
В походах под страхом смерти запрещалось употребление спиртных напитков.
Главными преступлениями, достойными страшного наказания, считали измену, трусость, убийство (среди своих) и воровство (опять же среди своих). Осужденных сажали в мешок, подсыпали туда песку и топили («в воду сажали»).
В поход казаки уходили в разном рванье. Холодное оружие, чтобы не блестело, вымачивали в рассоле. Зато после походов и набегов наряжались ярко, предпочитая персидскую и турецкую одежду.
По мере того как обживалась река, здесь появляются первые женщины. Некоторые казаки стали вывозить свои семьи с прежнего места жительства. Но большинство женщин было отбито, украдено или куплено. Неподалеку, в Крыму, был крупнейший центр работорговли. Современные исследователи обнаружили, что старинные казачьи мужские обрядовые песни явно великорусского происхождения, а женские обрядовые песни на Дону (колыбельные, хороводные, урожайные) очень похожи на песни Украины, Волыни, Полесья, Польши.
Многоженства среди казаков не было, брак заключался и расторгался свободно. Для этого казаку было достаточно поставить в известность круг.
В Войске все время его существования сохранялась определенная веротерпимость. Изначально среди православных казаков жили татары-мусульмане. Даже среди 15 сотен «новоприбывших» в середине ХVII века видим мы сотню мусульман во главе с Иссеняк-мурзой Колеватовым, князем Сабановым. Но мусульмане жили отдельно и замкнуто, роднились только внутри своего сообщества.
Позже, когда на Руси начался великий церковный раскол, большинство казаков придерживались православия по учению Никона, но и старообрядцев не притесняли, которых на Дону появилось немало. И старообрядцы жили компактно, старались не смешиваться с остальными казаками, хотя вместе ходили в походы, вместе выбирали войскового атамана.