Экспонатам, представляющим императорский ВМФ, уделено достойное место. Немалый интерес вызывает управляемая смертниками торпеда «Кайтэн». Она несла 1500 кг взрывчатки и выпускалась с подводных лодок. Как предполагало японское верховное командование, «кайтэны» должны были нанести американским ВМС катастрофические потери, что изменило бы ход войны. В 1944-1945 гг. смертники на «кайтэнах» провели ряд успешных атак против американских кораблей. Предполагается, что такой человеко-торпедой был потоплен тяжелый крейсер «Индианаполис».
После пуска с подлодки пилот с помощью перископа наводил «Кайтэн» на цель. Затем он переводил торпеду в режим атаки: перископ убирался, включался максимальный ход. Если пилот промахивался, то погибал мучительной смертью от недостатка кислорода. Поэтому позже на «кайтэнах» стали устанавливать механизм самоликвидации. По разным данным, в человеко-торпедах погибло около 100 смертников. Это было «оружие отчаяния», так как ход войны был уже предрешен. Рядом с человеко- торпедой выставлена хвостовая часть обычной парогазовой торпеды. Она применялась и для «кайтэнов» тоже.
В музее имеется скульптура водолаза- смертника «фукурю». Его оружие – шестовая мина (с 8 кг взрывчатки), которой он должен был ударить в днище вражеского судна.
Имеется в коллекции музея и быстроходный катер со взрывчаткой, управляемый надводным тэйсинтай «синъе». Такие катера использовались японцами на Филиппинах. А рядом в витрине можно видеть его модель с фигурой смертника.
Здесь же выставлены зенитное корабельное орудие, снаряды главного калибра 457-мм с суперлинкоров «Ямато» и «Мусаси» и 140-мм орудие с линкора «Нагато», который был первым линкором, полностью спроектированным и построенным в Японии. Этот корабль вступил в строй в 1920 г. и нес новейшее на тот момент артиллерийское вооружение. Причем 140-мм пушки были новинкой для японского флота, корабли которого ранее вооружались 152-мм и 120-мм орудиями британского образца. «Нагато» участвовал в боях при Мидуэй и в заливе Лейте. Это был единственный из всех японских линкоров, который уцелел во время войны. После войны корабль использовался в качестве мишени при американских ядерных испытаниях у атолла Бикини. Во время второго испытания 29 июля 1946 г. линкор затонул.
В зале находятся также модели японских боевых кораблей. Например, изготовленные в масштабе 1:100 модели тяжелых крейсеров «Такао» («Такао») и «Майа» («Мауа»). Модель авианосца «CoKaKy»(«Shokaku») выполнена в масштабе 1:50. Эта точная копия была построена Токийским клубом моделистов за два года. Члены клуба вручили ее музею Юсюкан, чтобы почтить память погибших моряков экипажа «Сокаку».