На основании директивы Генерального штаба Советской Армии от 25 июня 1953 г. 978-й отдельный военно- транспортный авиационный полк был сформирован на базе двух авиационных эскадрилий: 88-й отдельной учебно-тренировочной авиационной эскадрильи ИА ПВО страны и 66-й отдельной смешанной авиационной эскадрильи ВВС. Первым командиром полка стал полковник Владислав Николаевич Орлов. Полк формировался как смешанный – две эскадрильи тяжелых транспортных самолетов и одна (3-я) эскадрилья боевых самолетов. На вооружении транспортных эскадрилий состояли самолеты Ли-2 и С-47, на вооружении 3-й эскадрильи – истребители МиГ-15 и МиГ-17, а также бомбардировщики Ил-28.
1-я и 2-я АЭ выполняли задания по транспортным перевозкам в интересах истребительной авиации ПВО, проще говоря, доставляли людей и грузы в гарнизоны ПВО. На базе 3-й эскадрильи поддерживали летные навыки офицеры управления командующего ИА ПВО на реактивных самолетах. Транспортные эскадрильи и штаб полка дислоцировались в Люберцах, «реактивная» – в Клину. С первых дней существования полка личный состав приступил к выполнению оперативных заданий штаба авиации ПВО. С июня по 1 декабря 1953 года полк налетал 1520 часов, а в следующем, 1954, году уже 5337.
В 1955 г. перед 2-й эскадрильей полка была поставлена задача переучиться на новый тип – самолет Ил-14. Переучивание было завершено в 1956 г. 3-я эскадрилья получила на вооружение сверхзвуковые истребители МиГ-19. В 1959 г. экипажи полка налетали 6702 ч. без летных происшествий, в связи с чем личный состав приказам командующего ИА ПВО страны от 23 декабря 1959 г. был поощрен денежной премией.
С 19 марта 1960 года штаб и транспортные эскадрильи были передислоцированы в Клин. Приказом командующего авиацией ПВО страны от 30 июля 1960 года полк объявлен «Отличным». В 1960 г. экипаж капитана Усенко первым в полку переучился на Ан-12, освоив полеты в ПМУ. В 1961 г. на Ан-12 переучился второй экипаж – капитана Минина. Самолеты Ан-12 долгое время состояли на вооружении полка, но их количество никогда не превышало двух машин, поэтому массового переучивания летного состава не производилось. Вообще, 978-й полк отличался богатым разнообразием состоявших на вооружении типов летательных аппаратов – порядка двадцати самолетов. Имелись даже вертолеты Ми-8.
На рубеже 50-60-х годов советская военная авиация бурно осваивала Север и Дальний Восток. Аэродромы и гарнизоны истребительной авиации ПВО страны строились на Сахалине, Камчатке, Чукотке, в Заполярье. С 1960 г. транспортные перевозки за «край географии» стали выполнять экипажи 1-й и 2-й эскадрилий 978-го полка. Также выполнялись перевозки за рубеж, в страны Народной Демократии, как тогда называли социалистические страны Восточной Европы. Полеты выполнялись всюду, где имелись гарнизоны истребительной авиации ПВО. Помимо перевозок, транспортные эскадрильи обеспечивали парашютно-десантную подготовку летного состава ИА ПВО. К примеру, в 1963 г. было десантировано 427 человек.
