Войска были разделены между пятью военными округами со штабами в Пиуре, Лиме, Арекипе, Куско и Икитосе, а часть находилась непосредственно в распоряжении главного командования. Зона конфликта 1995 г. находилась на территории ответственности 5-го военного округа (Икитос).
Характерной особенностью технического оснащения сухопутных войск и ВВС Перу было то, что эта страна после прихода к власти левонастроенных военных в 1968 г. и вплоть до 1991 г. была единственной в Южной Америке, приобретавшей в СССР значительные партии советского вооружения, составившего в итоге фактически основу их боевого потенциала.
На начало 1995 г. на вооружении сухопутных войск находилось около 375 средних танков Т-55, 110 легких танков АМХ-13, 160 БРМ и бронеавтомобилей, 560 бронетранспортеров, 24 155-мм самоходные гаубицы, 450 буксируемых артиллерийских орудий, 14 122-мм РСЗО БМ-21, большое количество минометов, безоткатные орудия. В качестве средств войсковой ПВО использовались 35 зенитных самоходных установок ЗСУ-23-4, до 200 зенитных пушек, а также переносные ЗРК «Стрела-2М», «Стрела-3» и «Игла-1». Армейская авиация насчитывала 9 легких самолетов и 48 вертолетов (в том числе 28 Ми-8 (Ми-17) и два Ми-6).
Численность личного состава военно-воздушных сил Перу составляла 15 тыс. чел. Организационно они были сведены в девять авиагрупп, состоящие из эскадрилий. Авиагруппы подчинялись командованию пяти авиакрыльев, зоны ответственности которых совпадали с военными округами. На вооружении к началу 1995 г. находилось 14 легких бомбардировщиков Canberra, 34 истребителя-бомбардировщика Су-22, 12 истребителей Mirage 2000, 17 истребителей Mirage 5, 25 легких штурмовиков А-37В, 120 транспортных и связных самолетов (из них 10 С-130, пять L-100 и 14 Ан-32), 59 учебных самолетов (в том числе 13 МВ-339, которые могли использоваться как легкие штурмовики), 20 боевых вертолетов Ми-25, 124 транспортных и многоцелевых вертолета (в том числе 35 Ми-8 и Ми-17 и пять Ми-6). Для прикрытия административных центров имелось три дивизиона ЗРК С-75 и шесть дивизионов ЗРК С-125М.
В то же время боеготовность ВВС Перу была весьма низкой — фактически в летном состоянии к началу конфликта из боевых самолетов были лишь три Mirage 2000, четыре Canberra, семь Су-22 и восемь А-37В, а также пять боевых вертолетов Ми-25. Функционировали лишь 45 % наземных РЛС контроля воздушного пространства, а из ЗРК действующими были только два дивизиона С-125М[42].
Военно-морские силы Перу насчитывали 22 тыс. человек, из которых 12 тыс. служили по призыву. Корабельный состав включал восемь дизель-электрических подводных лодок (шесть проекта 209 и две старые типа Abtao), крейсер Almirante Grau, эскадренный миноносец Ferre, четыре современных фрегата типа Lupo, шесть корветов типа Velarde, четыре больших десантных корабля, вспомогательные суда. На многочисленных внутренних водоемах находились семь речных канонерских лодок, два транспорта и не менее 25 сторожевых катеров. В состав ВМС также организационно входила береговая охрана, насчитывавшая 21 сторожевой катер. Морская пехота (3000 человек) включала бригаду и отдельную группу коммандос. На вооружении находилось 60 бронетранспортеров, минометы, безоткатные орудия, 20-мм зенитные пушки. Крыло морской авиации имело восемь патрульных самолетов S-2, восемь транспортных и пять учебных самолетов, 12 противолодочных и 28 прочих вертолетов (в том числе три Ми-8).