Весь 1938 год проводилась работа по оптимизации структуры НКВД. Было признано, что существующая организационная структура ГУГБ не соответствовала задачам борьбы с подрывной деятельностью иностранных разведок и «враждебными элементами» внутри страны (троцкисты, правые, эсеры, меньшевики, контрреволюционное духовенство, сектанты, различного рода националистические антисоветские формирования и т. п.). По мнению руководства НКВД, структура Главного управления государственной безопасности была громоздка, отсутствовало четкое разделение функций между отделами управления. Ряд отраслей народного хозяйства и объектов культуры оставались вне поле зрения контрразведки. В целях приведения структуры органов государственной безопасности в соответствие с задачами наиболее полного охвата оперативно-чекистскими мероприятиями всех отраслей хозяйства, культуры и управления, а также для наиболее успешной борьбы с проявлениями всех видов контрреволюции решением Политбюро ЦК ВКП(б) от 28 марта 1938 г. была утверждена новая структура НКВД СССР, которая была объявлена приказом НКВД № 00362 от 9 июня 1938 г. [136]
Из состава ГУГБ НКВД СССР были выделены в самостоятельные подразделения – Особый отдел (5-й отдел), а также 6-й и 11-й отделы, обслуживающие железнодорожный, водный, авиационный транспорт, шоссейно-дорожные организации и связь. Таким образом, структура НКВД СССР представляла собой оперативно-чекистские управления: Управление государственной безопасности – Первое управление; Управление Особых отделов армии и флота – Второе управление; Управление транспорта и связи – Третье управление, а также самостоятельные оперативно-чекистские отделы: оперативного учета, регистрации и статистики [137] ; оперативной техники [138] ; секретно-шифровальный; тюремный. [139]
Функции и линии работы были обозначены:
1-е управление: НКВД СССР: 1-й отдел (охрана правительства), 2-й (оперативный: наружное наблюдение, установки, розыск, арест), 3-й (контрразведывательный), 4-й (секретно-политический), 5-й (иностранный), 6-й (контрразведывательная работа в военизированных организациях: милиция, пожарная охрана, Осоавиахим [140] , военкоматы, спортивные общества), 7-й (контрразведывательная работа в оборонной промышленности), 8-й (контрразведывательная работа на объектах тяжелой, машиностроительной, легкой и местной промышленности), 9-й (контрразведывательная работа на объектах Наркомата земледелия, Наркомата совхозов, Наркомата заготовок, Наркомата пищевой промышленности, Наркомата торговли, Наркомата финансов, Центросоюза);