Помпей велит достойно похоронить старинного недруга Рима и оставляет Фарнака на троне, но только на небольшой части бывшей империи Митридата. До поры Фарнак демонстрирует лояльность Риму в качестве союзника. Но смерть Помпея и гражданская война словно вселяют в него дух Митридата, и он быстро захватывает Вифинию, Каппадокию и Малую Армению. И совершенно в духе своего папаши устраивает зверскую расправу над пленными римлянами, кастрируя их.
Спешно набранное войско Гнея Домиция Кальвина, легата Цезаря, не может остановить Фарнака. Плохо обученные и не имевшие опыта боевых действий легионеры разгромлены. Опасность нависает над Азией.
Поэтому летом 47 года до P. X. Цезарь прибывает в сирийскую Антиохию, а затем в Таре, столицу Киликии, чтобы собрать налоги на содержание своих легионов, приведенных из Египта.
Фарнак знает, кто такой Цезарь. От царя прибывают послы с дарами и предложением мира. Правда, в обмен на захваченные территории. Цезарь требует, чтобы Фарнак вернул захваченное и освободил пленных.
Решающее и единственное сражение произошло у городка Зела, расположенного на холме. Цезарь занимает позицию на вершине другого холма и начинает строить лагерь.
Фарнак внезапно нападает на римлян, что в глазах Цезаря выглядит новшеством в тактике: идти в атаку по крутому склону — смелость на грани идиотизма. От удивления римляне несколько теряются, но быстро опрокидывают наступающих, и все кончается разгромом. Самому Фарнаку и немногим уцелевшим удается спастись. Царь возвращается на Боспор и, набрав армию из скифов и сарматов, захватывает Феодосию и Пантикапей. Но некий Асандр, которому он доверил управлять царством в свое отсутствие, полагает, что ему больше подходит трон, восстает против Фарнака и в итоге убивает его.
Цезарь же, проведя свою самую кратковременную кампании, отправляет в Рим самый краткий отчет, вошедший в историю: «Veni, vidi, vici», то есть «Пришел, увидел, победил».
Скорее всего, после победы над Фарнаком Цезарь с удовольствием вернулся бы в Египет, где его ждали объятия Клеопатры и царские почести. Но дела в Италии расстроились настолько, что срочно требовалось его личное присутствие.
За год до возвращения Цезаря в Рим претор Марк Целий Руф, человек беспринципный, но всегда держащий нос по ветру, внес законопроект по отсрочке выплаты долгов на шесть лет, а потом предложил их вообще отменить. Сенат отреагировал сразу и сместил Руфа с должности. Тогда он сбежал из Рима на юг Италии, где в это время бывший трибун Милон затевал смуту. Вместе они принялись сеять недовольство среди бедняков, обещая аннулировать все долги, а рабам — свободу, если они присоединятся к их восстанию против Цезаря. Желающих нашлось много: экономика Республики лежала в руинах, подвоз зерна шел с перебоями, квартплата выросла, остальные цены тоже, а ростовщики совсем распоясались.