И. И. Краснова в сентябре 1848 г. увольняют с должности командира полка, и он возвращается на Дон, где занимается садоводством, пытается развести виноград в своем Краснополье. Виноград прижился, но плодов вырастить не удалось. Помимо садоводства, Краснов углубляется в историю донского казачества, печатает свои статьи в столичных и донских изданиях. Прежде научных исследований Краснов занимался литературным трудом. В воспоминаниях Краснова 2-го характеризуют как высокообразованного и разностороннего человека.
Тем временем, с началом Крымской войны, его вновь призывают на службу и назначают Походным атаманом донцов для защиты побережья Азовского моря. Последнее повышение делает его генерал-лейтенантом, и в 1855-м — начальником отряда береговой обороны Таганрога. Спустя 30 лет И. И. Краснов вернулся в город, из которого увозил гроб Александра I. Порученный ему город Краснов отстоял, пережив неприятельский десант и продолжительную бомбардировку с моря 21 мая 1855 г., от которой только сгорело около сотни домов. «Соединенная флотилия двух просвещенных государств не устыдилась в продолжение шести с половиной часов совершить неслыханное и вовсе бесполезное злодейство против мирного, почти беззащитного города, который не мог отвечать ни одною пушкою и который так часто во дни нужды питал их своею превосходною пшеницею. По уверению опытных моряков и старых артиллеристов, неприятель выпустил более 1000 разных снарядов. Впоследствии найдено около ста неразряженных конических бомб обыкновенных и гранат более 500. Многие дома были испещрены ударами бомб и ядер…», — записывает сам Иван Краснов. Не вынудив к сдаче город, англо-французская эскадра перешла к осаде других азовских портов. Донской казак Г. П. Чеботарев, знавший П. Н. Краснова, вспоминал, как в декабре 1918 г. атаман показывал военной миссии Антанты пушки с британской канонерки Джаспер, захваченные его дедом и поставленные у входа в Новочеркасский Донской музей, построенный в центре города и открытый в 1899 г. Вспоминая слова атамана Краснова, Чеботарев запутался, в примечании назвав дедом отца Краснова, прапорщика Н. И. Краснова [85, с. 290].
Сын Ивана Ивановича-младшего, Николай Краснов (1833 г. р.) тоже принимал активное участие в обороне города. Таганрог отстояли полностью к удивлению англичан, не ожидавших такого сопротивления. (Об этом Иван Краснов напишет научный труд «Оборона Таганрога и берегов Азовского моря в 1855 году», — В. Королев в 1991 г. счел его самым солидным трудом на эту тему «даже в настоящее время»).