С детских лет отец Епифаний горел желанием послужить Церкви в сане простого пресвитера, оставаясь в безвестности, вдали от церковных должностей и временных мирских почестей. Это отвечало как его прямому характеру, так и его твердым убеждениям, основанным на библейской и святоотеческой традиции, церковных канонах, благочестивом послушании Церкви. Основополагающий принцип, которого придерживался батюшка, состоял в том, чтобы, следуя примеру святого апостола Павла, заниматься «безвозмездной проповедью Евангелия», служить Церкви, не получая за это никакого материального вознаграждения. Всю свою жизнь батюшка не имел постоянной финансовой поддержки, он сам зарабатывал себе на жизнь, особенно в первые годы пастырского служения, работая литературным редактором в издательстве братьев Пападимитриу «Астир». Все свои житейские попечения отец Епифаний возложил на Господа. Вершиной премудрости, как он сам говорил, были для него литургические слова: «…сами себе, и друг друга, и весь живот наш Христу Богу предадим».
В 1956 году приснопамятным митрополитом Этолийским и Акарнанийским Иерофеем он был рукоположен во диакона. В том же году была издана его первая книга по апологетике «Священное Писание и лукавые духи». С 1956 по 1961 год, уже в сане диакона, отец Епифаний жил в Каламе, занимаясь, главным образом, изучением творений отцов Церкви. В 1961 году блаженнейшим митрополитом Елевферопольским Амвросием, с которым у отца Епифания были очень близкие духовные связи, он был рукоположен во пресвитера.
Все двадцать восемь лет своего священнического служения основным занятием, которому он всецело посвятил себя, было совершение Таинства Исповеди в храме Трех Святителей в Афинах. Глубоко сознавая, что Бог призвал его послужить Своей Церкви в качестве пастыря Покаяния, Отец Епифаний с неослабевающей ревностью трудился на этом поприще, и результаты его трудов были поистине поразительны. Тысячи людей, проходя через его исповедальню и оставляя там бремя своих грехов, получали духовное умиротворение и обращались на путь христианской жизни. Многие из духовных чад Старца стали монахами на Святой Горе Афон, Кипре и в других местах, иные же избрали путь пастырского служения.
Неся послушание духовника и окормляя десятки тысяч душ, отец Епифаний успевал заниматься и писательской деятельностью. Его перу принадлежат многочисленные статьи в различных церковных периодических изданиях. Он является автором двадцати двух книг, многие из которых неоднократно переиздавались.
Любовь к Церкви, стремление сохранить ее богоданные установления, неукоснительная преданность святым канонам часто подталкивали отца Епифания к тому, чтобы, оставив безвестность, возвысить свой голос в защиту православной веры, жизни по евангельским заповедям, канонических норм и прав Церкви. Его исследования, статьи, отзывы, доклады и письма, посвященные самым актуальным вопросам церковной жизни, — настоящий памятник современного церковного проповедничества. Они свидетельствуют о глубине богословского понимания, апостольских воззрениях, святоотеческом духе и цельности церковного сознания их автора.