В октябре 1508 г. в Москве с прибывшими туда литовскими представителями был заключен вечный мир между государствами в рамках границ предыдущего перемирия, т. е. стороны отказались от приобретений прошедшей войны. Князьям Глинским было разрешено покинуть Литву и перейти на службу к московскому великому князю, но с потерей своих литовских владений. Великий князь Василий III наградил литовского мятежника князя Михаила Глинского городами Малым Ярославцем и Медынью.
В следующем году при посредничестве германского императора Максимилиана был заключен мир с Ливонским орденом сроком на 14 лет. Ливонцы отказались от союза с Польшей, а новгородцы, которым и было поручено заключение мирного договора, отпустили взятых в предыдущей войне пленных ливонцев. Согласно этому договору, возобновилась торговля Новгорода с ганзейскими городами.
В период временного затишья в отношениях с соседями великий князь обратился к поиску внутренних врагов: на этот раз пришел черед завоевания Москвой Господина Великого Пскова. Граждане этого торгового государства, будучи союзниками великого князя Ивана III в борьбе с Новгородом, надеялись, приняв наместником от Москвы князя Ивана Репню-Оболенского, сохранить свое полунезависимое положение и при новом великом князе. Началось все с того, что великий князь Василий III совершавший поездку в Новгород, получил там от псковичей жалобу на действия своего наместника. В ответ великий князь предложил псковичам прибыть вместе с наместником в Новгород на великокняжеский суд. И те, поверив в возможность праведного суда, отправили гонцов во все псковские земли собрать обиженных наместником. Псковичи прибыли в Новгород, где их всех арестовали. Но даже весть об этом событии не подняла псковичей на выступление против великого князя: проглотив обиду, они согласились и далее подчиняться Москве.
Великий князь был согласен помиловать Псков только на определенных условиях, как сообщает Псковская первая летопись: «Если вы, отчина моя, посадники псковские и псковичи, еще хотите по-старому пожить, то должны исполнить две мои воли: чтобы не было у вас веча, и колокол бы вечевой сняли долой, и чтобы в Пскове были два наместника, а в пригородах по наместнику, – и тогда вы еще поживете по-старому» [62, 399]. И псковичи согласились, сняли вечевой колокол и отвезли на двор наместника, после чего в Псков прибыл великий князь Василий III.
Псков постигла та же участь, что и Новгород: все посадники, бояре, торговые и зажиточные люди были арестованы и с легкой поклажей отправлены в Москву с семьями и вместе с теми людьми, что были ранее арестованы в Новгороде. Всего было выселено из Пскова триста знатных фамилий. А псковские пригороды и волости великий князь раздал московским боярам и детям боярским.