Проходили годы, и обстановка в Туркестане менялась. После четырнадцати лет управления краем, вместивших военные походы, глубокие реформы и важные экономические начинания, сошел со сцены «полуцарь», имевший большую власть, Константин Петрович фон Кауфман. В начале 1881 г. его сразил тяжелейший инсульт, и более года вплоть до своей кончины 3 мая 1882 г. он лежал парализованный в своем дворце. Его преемники на посту генерал-губернатора не могли по масштабу личности равняться с ним, да и многих прерогатив должности их лишил Императорский указ. Кауфман был не только завоевателем, но и первоустроителем края, отчего пользовался особым авторитетом как в Петербурге, так и в Туркестане, более того – он управлял среднеазиатскими народами намного дольше тех, кто приходил ему на смену: иные начальники края исполняли должность всего лишь год. Никого из генерал-губернаторов послекауфманской поры не называли «полуцарем», да и возможностей приобрести славу фон Кауфмана у них уже не было – им оставалось продолжать его дело.
Постепенно у аборигенов прошел страх перед чужеземцами с их пушками и скорострельными винтовками. Неверные не рубили головы, не резали людям горло, как баранам, не занимались членовредительством, не сажали на кол, не громили мечети, не мешали муэдзинам кричать с минаретов, не трогали жен и дочерей правоверных, не мешали торговать, то есть практически не вмешивались в устоявшиеся веками обряды и обычаи. Гяуры были как бы сами по себе, а правоверные тоже сами, и это не прибавляло уважения к завоевателям. Страх прошел, а склонность к бунту сохранилась.
Пожалуй, только в 1892 г., спустя более четверти века после начала интенсивного силового проникновения России в Среднюю Азию, русская администрация столкнулась с серьезным возмущением местного населения, причем в Ташкенте – столице генерал-губернаторства.
В июне того года в Ташкенте началась эпидемия холеры. Эпидемия возникла в перенаселенной и достаточно грязной старой части города. Городская администрация, возглавляемая полковником С.Р. Путинцевым, попыталась установить для всех жителей новые санитарные правила, которые могли бы замедлить, а затем и ликвидировать распространение болезни, но при этом не были учтены психология и обычаи городского населения. Новые правила предусматривали медицинский осмотр тел умерших, однако в связи с большим числом трупов и недостаточной численностью медицинского персонала требуемый осмотр откладывался на три-четыре дня. В условиях летней жары такое запаздывание было недопустимо – тела начинали разлагаться. К тому же среди русских инспекторов оказались молодые офицеры, не имевшие медицинского образования и не знавшие местных обычаев. Так они самовольно заходили на женскую половину в домах мусульман, чем вызывали раздражение хозяев: женская половина открыта только для главы семейства.