В январе 1914 г. — это была уже вторая зимовка — «Святая Анна» оказалась к северу от Земли Франца-Иосифа. В апреле часть экипажа, 13 человек вместе с Альбановым, решила совершить пеший поход с целью добраться до обитаемых мест. Они самостоятельно изготовили семь байдарок и саней. Сшили меховую одежду из шкур убитых во время зимовок животных. Запасы продовольствия подходили к концу (провиант был взят в расчете на 18 месяцев плавания), поэтому питание было очень скудным, в основном — сухари.
Группа Альбанова отправилась в поход, однако вскоре три человека — матросы А. Шахнин, М. Шабатура и И. Пономарев, поняв, что не смогут выдержать пеший поход, вернулись на «Святую Анну». Таким образом, на шхуне осталось 13 человек, в поход отправилось 10. Участники пешего похода планировали достичь земли Франца-Иосифа и на арктической базе ждать проходящего корабля. В конце июня полярники вышли к участку, свободному ото льда. Было решено, что часть группы пойдет на байдарках (их к тому времени осталось только две), а другая часть отправится по побережью на лыжах.
Группы встретились на мысе Ниль, который находился на острове Земля Георга. Далее байдарки продолжали плыть, а лыжники идти своим путем. Очередная встреча была назначена у мыса Гранта, но пешей группы в условленном месте не оказалось. За это время экипаж Альбанова потерял двух человек: один матрос пропал без вести, другой умер. Не дождавшись пешей группы, байдарки отправились в путь и достигли острова Белл, а от него поплыли к мысу Флора. Однако в самом начале пути налетевшим ветром в море была унесена одна из байдарок с двумя матросами. Вторая байдарка с Альбановым и матросом Александром Конрадом, чтобы не разделить участи погибших товарищей, вынуждена была повернуть к острову Белл.
Почти через месяц (9 июля) В. Альбанов и А. Конрад добрались до арктической базы Джейсона на острове Нортбрук. В итоге они проделали путь в 400 км за три месяца. 20 июля двух оставшихся в живых членов экипажа Брусилова забрала шхуна «Святой Фока» под командованием Н. М. Сахарова.
На поиски «Святой Анны» было отправлено несколько спасательных экспедиций. Была также задействована полярная авиация. Однако шхуну обнаружить не удалось. В 2010 г. экспедиция Олега Продана на острове Земля Георга нашла человеческие кости и некоторые предметы обихода. Возможно, это были следы группы, которая шла по побережью.
По поводу исчезновения «Святой Анны» выдвигались различные версии.
1. На шхуне произошел пожар и она сгорела.
2. Причиной гибели людей и судна мог быть сильный полярный шторм.