Жертвами репрессий стали также тайно прибывающие в страну с 1574 года выпускники католической духовной семинарии в городе Дуэ (Испанские Нидерланды). Центр, созданный в 1568 году кардиналом Уильямом Алленом, готовил священников, дабы отправить их в Англию для поддержки лишенных пастырской опеки верующих-католиков. До 1580 года в Англию прибыли около 100 священников из Дуэ. В последующие годы их число возросло до 471. Большинство из них были брошены в тюрьмы, где подвергались жестоким пыткам, некоторые были казнены.
Сожжение на костре Томаса Кранмера (1489–1556), архиепископа Кентерберийского. Ксилография из «Книги мучеников» Джона Фокса, 1563 г.
Английские протестанты-пилигримы вступают на палубу корабля «Спидвелл», отправляясь в Америку. Роберт Уолтер Вейр, XIX в., Музей искусств Бруклина, США, Нью-Йорк
Первой жертвой стал Катберт Мейн, в ноябре 1577 года повешенный и четвертованный на глазах толпы. В 1580 году в Англию приехали первые миссионеры-иезуиты. Один из них, Эдмунд Кампион, через несколько месяцев конспиративной деятельности был схвачен, подвергнут пыткам и казнен как государственный изменник. Суровые репрессии ожидали и тех, кто укрывал католических священников или оказывал им помощь.
В разбросанных по всей Англии замках и крепостях (например, в Висбиче, Йорке, Уигморе) только в 1583 году в заточении оказались 103 католика. В портах проводились тщательные обыски — корабли и товарные склады проверялись в поисках нелегальных приезжих и католических предметов культа (распятий, икон), распространение которых было строжайше запрещено. Студентов, получавших образование за пределами Англии, немедленно отозвали обратно, а тех, кто не подчинился, сочли изменниками. Антикатолические настроения достигли пика во время войны с Испанией, их проявлением стало принятие в 1585 году очередных суровых законов, направленных против «иезуитов, священников и прочих отступников». Законодательные акты спровоцировали очередную волну преследований. С 1586 года до конца правления Елизаветы I были казнены 146 католиков, якобы виновных в государственной измене. В 1570–1603 годах по этому обвинению было казнено около 250 человек. Суровые репрессии, отсутствие пастырской опеки и возможности открыто исповедовать католичество привели к снижению численности католиков: на рубеже XVI–XVII веков их число составляло 30–40 тысяч человек — менее одного процента населения. Несмотря на это, они по-прежнему оставались удобной мишенью для пропагандистских нападок, особенно в периоды политических кризисов.