Еще одной угрозой для религиозного единства страны были действия протестантских радикалов — пуритан, — призывавших к дальнейшим реформам и очищению Англиканской церкви от следов католицизма и папизма. При жизни Елизаветы I такие выступления имели единичный характер и еще не составляли реальной угрозы, однако королева относилась к ним настороженно и боролась с ними. Например, в тюрьме оказались Уильям Стрикленд, инициатор введения в 1571 году новой версии молитвенника, и Энтони Коуп, который решился на подобные действия в 1587 году. В Тауэр также был заточен вставший на защиту Коупа член парламента Питер Уэнтворт. Кроме того, любые разночтения с официальной церковной доктриной сурово искоренялись, а несоответствующие англиканским канонам религиозные произведения и их авторы жестоко карались. Безжалостно преследовались также лица, распространявшие «нелегальную» литературу. В 1583–1584 годах не менее пяти человек были приговорены к смерти за тиражирование раскольнических текстов. При этом, однако, следует подчеркнуть, что репрессии против протестантских раскольников никогда не приобрели таких масштабов, как преследования католиков. Несмотря на приложенные усилия, властям не удалось сдержать нарастающую критику и раскол внутри Англиканской церкви. Новые течения возникали в оппозиции к официальной Церкви и ее доктрине, особенно во время правления первых Стюартов.
Волны протестанткой эмиграции
Из страха перед преследованиями некоторые радикальные религиозные группы, например сепаратисты, искали спасения за границей, иногда в Голландии, а иногда (что было новым веянием) — в Новом Свете. В 1620 году на корабле «Мэйфлауэр» в Америку приплыла первая группа, насчитывавшая около сотни протестантских беженцев, именуемых пилигримами. Их примеру последовали и другие. В 1628 году на территории Новой Англии проживало уже почти 10 тысяч протестантов, в основном пуритан и сепаратистов. Годы гражданской войны в Англии (1640–1660) углубляли разделение по религиозному признаку. Раскол сопровождался также политическим соперничеством, так как спецификой событий, получивших название Английской революции, было глубокое взаимопроникновение конфликтов на почве вероисповедания и текущей политики.
ПРАВИЛО, ПРИНЯТОЕ ВИЛЬГЕЛЬМОМ III ОРАНСКИМ И ЗАПИСАННОЕ В ДЕКЛАРАЦИИ ПРАВ БРИТАНСКОГО НАРОДА В 1689 ГОДУ, ГЛАСЯЩЕЕ, ЧТО ПУТЬ НА АНГЛИЙСКИЙ ПРЕСТОЛ ДЛЯ КАТОЛИКА ЗАКРЫТ, ДЕЙСТВУЕТ ДО НАШИХ ДНЕЙ.
Наличие разнообразных течений протестантизма в английской общественной жизни не означало религиозной толерантности. На ситуацию, в которой находились отдельные религиозные сообщества, непосредственное влияние оказывали политическая ситуация и отношение властей. Только в 1689 году во время Славной революции была провозглашена свобода вероисповедания, однако это положение касалось лишь протестантов. Католикам, как в годы правления первых Стюартов, так и во время гражданской войны, приходилось мириться с различными ограничениями, хотя кровавые преследования им уже не угрожали. Яков I Стюарт прекратил политику репрессий, создавая вместо этого административные препоны и трудности в получении различных должностей, в том числе запретив католикам царствовать на английском престоле.