Евреев собрали в трёх лагерях, а в начале мая 1944 года их начали отправлять в Освенцим. Всего из венгерской зоны оккупации в Освенцим было отправлено более 10 тысяч евреев Воеводины. Из 16 тысяч евреев, проживавших в венгерской зоне оккупации в 1941 году, за время войны было уничтожено 14 тысяч.
В Македонии, которая была оккупирована болгарской армией, в 1941 году проживало 8 тысяч евреев. Их преследования начались осенью 1942 года, когда там были опубликованы антиеврейские законы. В феврале 1943 года завершились переговоры между немецкими и болгарскими представителями, в ходе которых немцы достигли соглашения с болгарами об отправке евреев Македонии в лагеря смерти.
11 марта 1943 года болгарская полиция арестовала евреев, проживавших в Македонии, и заключила их в лагерь в Скопье. 22–29 марта большинство евреев были отправлены в Треблинку и уничтожены. В конечном счёте погибли 7144 македонских еврея. Лишь около тысячи спаслись.
Всего из 80 тысяч евреев, проживавших на территории Югославии в 1941 году, во время Катастрофы погибли 66 тысяч (82 %). Евреи страны принимали активное участие в партизанском движении, воюя в рядах Народно-освободительной армии Югославии под командованием И. Броз Тито. В рядах партизан сражались 4572 еврея, из них 3 тысячи – в боевых частях.
В Албании по переписи 1930 года жили 204 еврея. В апреле 1939 года Италия оккупировала страну. После немецкого вторжения в Югославию весной 1941 года часть евреев Сербии и Хорватии бежали на албанскую территорию. В сентябре 1943-го, после выхода Италии из войны, немцы оккупировали почти всю Албанию. 400 евреев были вывезены в Берген-Бельзен. В живых остались около 100 человек.
В Греции накануне войны насчитывалось 77 тысяч евреев. В октябре 1940 года на Грецию напала Италия, а к июню 1941 года вся Греция была оккупирована войсками Германии, Италии и Болгарии. В немецкой зоне оккупации антиеврейские репрессии начались сразу же после вступления немцев в Салоники, в апреле 1941 года. В марте 1943-го всех евреев переселили в гетто, а затем отправили в лагеря смерти (из этой зоны было депортировано 49 285 евреев). Всего в концлагерях погибли 65 тысяч (около 85 %) евреев Греции. Следует отметить, что во всех оккупированных районах греки укрывали евреев.
Положение евреев в итальянской зоне оккупации было лучше, чем во всех прочих. Их в первые годы войны не преследовали, и расовые законы на этой территории итальянцами не соблюдались. Однако, когда немцы после капитуляции Италии 3 сентября 1943 года заняли всю Грецию, значительное число афинских евреев было отправлено в Освенцим. В болгарской зоне, включавшей Восточную Македонию и значительную часть Фракии, более 11 тысяч евреев были депортированы властями Болгарии в Польшу, в лагеря смерти.