Во второй половине 1943 года по решению Государственного комитета обороны Черноморская АСС, не ослабляя аварийно-спасательного обеспечения боевых действий флота, приступила к массовому судоподъему на Кубани, в освобожденном Новороссийске и в портах Азовского моря. Новороссийский АСО из Очемчири и Геленджика вернулся к месту своего постоянного базирования. Дополнительно в Новороссийск были переброшены аварийно-спасательный отряд, сформированный в Батуми, и отряд подводно-технических работ из Поти.
На Кубани формируются два АСО — в Темрюке и Краснодаре. Восстанавливается отряд в Ейске. В 1944 году создаются Севастопольский, Мариупольский и Николаевский отряды. Организуется АСО в Констанце (Румыния) с выделенной из него группой в Варне (Болгария).
Для восстановления гидротехнических сооружений по типу Новороссийского отряда подводно-технических работ создаются отряды в Севастополе и Одессе.
В первый же год новороссийские спасатели под руководством М. Ф. Чекова, Г. Н. Михайлова, П. Д. Ветова, А. И. Фигачева, С. С. Дурмашкина, А. Н. Кузнецова и других сумели поднять затопленный в порту на глубине 9 метров плавучий док грузоподъемностью 4000 тонн и развернуть подготовительные работы на других затонувших судах. В 1944 году был поднят эсминец «Бдительный», лидер «Ташкент», рефрижератор «Кубань», углеперегружатель, пассажирский теплоход «Украина», пароходы «Пролетарий», «Советский Крым», танкер «Вайян Кутюрье».
Значительные судоподъемные работы в 1944–1956 годах были выполнены в Феодосии. До мая 1945 года под руководством инженеров Тютрюмова и Ханыкова были подняты все затопленные в период Керченско-Феодосийской десантной операции транспорты.
С большими трудностями были сопряжены судоподъемные работы на Кубани: сильное течение, абсолютная замутненность воды, полный занос песком затонувших судов. В 1944–1945 годах отрядами, возглавляемыми А. Е. Болговым, И. Н. Романовым и Г. Н. Михайловым, здесь были подняты канонерские лодки «Дон» и «Буг», теплоход «Витязь» (1100 тонн), две баржи (по 980 тонн) и другие суда.
Мариупольский отряд в 1944 году поднял в порту танкер «Грозный» (14 000 тонн), дизельэлектроход «Труд» (11 000 тонн) и учебное судно «Товарищ» (2500 тонн). Руководили работами водолазный специалист П. Н. Литвинов и инженер С. С. Дурмашкин. В Керченском проливе под руководством инженера Ю. П. Тютрюмова были подняты пароход «Горняк» (2000 тонн) и танкер «Уралнефть» (3600 тонн), в бухте Сенная на Таманском полуострове — землечерпалка «Карл Маркс» (1000 тонн). В Поти извлечена со дна моря землечерпалка «Маяки» (1350 тонн), в устье реки Хопи — транспорты «Лепсе» (4700 тонн), «Камышин» (2500 тонн) и «Балаклава» (2000 тонн). Одесские спасатели в Днепровском лимане подняли плавкран грузоподъемностью 150 тонн, в Одессе — пароход «Чичерин» (2900 тонн) и землечерпалку «Ньюберг» (1900 тонн). В Николаеве под руководством инженера И. И. Друкера был завершен подъем плавучего дока (6000 тонн) и начата подготовка к подъему в Дидовой Хате под Николаевом плавучего дока (30 000 тонн).