Возмущенный подобными выходками, император готов был разогнать этот сброд, но он сознавал, что Горемыкину не справиться с беспорядками, которые последуют. [(По словам С.Ю.Витте, инициатором роспуска думы был Горемыкин, а отставки последнего - император.)] Тогда-то, в июле 1906 года престарелый премьер и ушел в отставку. На его место был назначен Столыпин. Два дня спустя новый премьер-министр приказал запереть двери Таврического дворца и расклеить на них царский манифест о роспуске Государственной Думы. В тот же день часть депутатов отправилась в Финляндию. Собравшись в лесу, депутаты заявили, что заседания Государственной Думы продолжаются. Участники встречи приняли "Выборгское воззвание", в котором призывали крестьян не платить государству податей и налогов и не поставлять рекрутов в армию до тех пор, пока не будет вновь созвана Дума. Но "Выборгское воззвание" ничего не достигло. Ошеломленные революцией, русские не хотели столкновений ради сохранения парламента.
Возмущенный своеволием членов Думы, государь хотел было положить конец эксперименту с представительным правительством, но Столыпин заявил, что, подписав манифест 17 октября, царь обещал народу гарантии, которые не вправе отнять у него. Скрепя сердце царь отказался от разгона парламента и согласился на выборы во 2-ю Думу.
Когда 2-я Государственная Дума собралась на первое свое заседание, рухнул потолок. То было достойное начало деятельности Думы, которая оказалась хуже прежней. Левые партии, в том числе эсдеки и эсеры, бойкотировавшие 1-ю Думу, получили двести мест, что составляло более трети состава 2-й Думы. Решив парализовать деятельность правительства, левые превратили Государственную Думу в сумасшедший дом, где раздавались выкрики, оскорбления, вспыхивали ссоры. Экстремисты другого толка - крайне правые - хотели во чтобы то не стало скомпрометировать Думу и закрыть ее раз и навсегда. Левых депутатов обвиняли в заговоре, дебаты превращались в бесцельные споры, выступления депутатов в адрес правительства становились все агрессивнее. И Столыпин ответил знаменитой речью, в которой в частности заявил: "Эти нападки рассчитаны на то, чтобы вызвать у правительства, у власти паралич и воли, и мысли. Все они сводятся к двум словам, обращенным к власти: "руки вверх". На эти два слова, господа, правительство с полным спокойствием, с сознанием своей правоты, может ответить только двумя словами: не запугаете".
Царь стал искать повод распустить и эту Думу. В двух письмах к императрице-матери он дал волю своему раздражению: