Органы государственной безопасности проделали титаническую работу по завоеванию и закреплению разведывательных позиций в тылу врага. За линией фронта действовали тысячи чекистов. От них регулярно поступала ценнейшая разведывательная информация военного и политического характера. Так, сведения, полученные от советских разведчиков летом 1943 года, помогли командованию Советской Армии своевременно узнать о планах наступления гитлеровцев на Орловско-Курской дуге и подготовить контрнаступление. В том же году чекистам удалось раскрыть и предотвратить диверсионно-террористический заговор фашистской разведки против глав правительств союзных держав — участников Тегеранской конференции.
Большое значение для борьбы с немецко-фашистской агентурой имело проникновение советских разведчиков в разведывательные и контрразведывательные органы и школы врага. Только на территории Белоруссии чекисты выявили 22 разведывательно-диверсионные школы абвера, 36 резидентур и несколько тысяч агентов. Благодаря этому деятельность отдельных разведывательных школ противника была настолько парализована, что их пришлось закрыть.
Большую роль в разведывательной и диверсионной деятельности в тылу врага сыграли оперативные группы органов государственной безопасности, которые создавались под непосредственным руководством партийных и комсомольских органов. Через своих разведчиков, внедрившихся в разведывательные центры и школы противника, оперативные группы собирали сведения о фашистской разведке, их агентуре, методах их подрывной деятельности. В течение 1943 года оперативные группы передали органам военной контрразведки сведения более чем о 1260 агентах, переброшенных противником в соединения действующей Советской Армии для проведения разведывательной и подрывной деятельности.
Оперативные группы действовали в тесном контакте с военным командованием. Они осуществляли диверсии на путях сообщения противника: пускали под откос поезда с войсками, горючим и боеприпасами; дезорганизовали работу тыла противника, что содействовало боевым действиям советских войск. Например, в первых числах мая 1942 года группа подрывников из оперативного отряда «Неуловимые» уничтожила крупную нефтебазу противника, снабжавшую горючим немецко-фашистские войска на Калининском фронте. В результате этой смелой операции снабжение горючим вражеских войск на Калининском фронте было нарушено.
Оперативные группы в тылу врага проводили значительную работу по ограждению партизанских формирований от проникновения вражеских агентов, по разложению антисоветских воинских формирований, вели борьбу с подрывной деятельностью организаций буржуазных националистов.