У Мидуэя японцев уже ждал «тёплый приём»: 4 июня 1942 г., после серии атак, американская авиация смогла вывести из строя все 4 авианосца Авианосного ударного соединения вице-адмирала Нагумо Тюити. После этого операцию «М1» пришлось отменить.
«Камикава-мару» в гавани о-ва Кыска, сфотографированный с борта «Кимикава-мару» 15 июня 1942 г. Перед средней и кормовой надстройками видны большие десантные катера типа «Дайхаиу»
Заправка самолётов топливом на гидроаэродроме Кыска, кадр из японской кинохроники 1942 г.
В планах японского флота ещё оставалась операция «AL» — захват островов Атту и Адак в Алеутском архипелаге.[* Следует отметить, что согласно первоначальным планам захват острова Адак предполагался только на время, достаточное для уничтожения на нём американских военных сооружений и минирования гавани. После этого оккупационные войска должны были покинуть Адак и высадиться на острове Атту, который и должен был стать их постоянной базой.] Её не стали отменять, но вместо Адака решили занять расположенный подальше от американских баз остров Кыска. При этом японцы решили не рисковать и максимально усилить задействованные в операции силы.
Поэтому в 20:20 6 июня «Камикава-мару» вместе с авианосцем «Дзуйхо», линкорами «Конго» и «Хиэй», крейсерами «Тонэ» и «Тикума», эсминцами «Хагикадзэ», «Майкадзэ» и «Новаки» были выделены из сил, предназначавшихся для Мидуэйской операции, и после дозаправки отправлены на усиление Алеутской операции. При этом «Камикава-мару», продолжая оставаться в 11-й дивизии авианосцев, 9 июня был включён в состав так называемого Гидроавианосного отряда Северных сил — фактически сводной дивизии гидроавианосцев, в которую также вошли «Кимикава-мару» и эсминцы «Сиокадзэ» и «Хокадзэ».
В 07:00 15 июня «Камикава-мару» прибыл в гавань острова Кыска, где вместе с прибывшим ранее «Кимикава-мару» начал организовывать гидроаэродром. Четыре F1M2 были немедленно запущены в воздух для противолодочного и противовоздушного патрулирования над якорной стоянкой. Предосторожность оказалась не лишней, поскольку уже в 08:20 над островом появились 7 американских бомбардировщиков (4 В-17 и 3 В-24). В течение почти часа два самолёта из состава патруля отражали налёт, при этом один из них получил повреждения от пулемётного огня.
Тем временем работы по организации гидроаэродрома продолжались. Самолёты были спущены на воду и переведены на берег, неподалёку от которого был установлен ряд швартовых буёв, к которым гидросамолёты швартовались при хорошей погоде. Если погода была плохой, а также для проведения технического обслуживания гидросамолёты вытаскивались на берег по специально расстеленным на берегу бамбуковым матам. Если ветер был особо сильным, то гидросамолёты использовали для взлёта и посадки находившуюся севернее гавани лагуну Салмон с её гораздо более спокойными водами. Туда же самолёты перегоняли для проведения ремонта. Следует отметить, что, несмотря на все усилия японцев, небоевые потери гидросамолётов были очень высокими. По данным, приведённым капитаном 2 ранга Миура (бывшим командиром авиагруппы «Камикава-мару») на послевоенном допросе, 60% потерь гидросамолётов пришлись на волны или иную непогоду, и только 40% машин были сбиты бортетрелками американских бомбардировщиков или выведены из строя в результате атак с воздуха.