Провал нескольких предложений по совместному использованию воды в этот период подтвердил, что водный вопрос занимал важнейшее место во внешней политике арабских стран и Израиля. К примеру, когда в 1952 г. американский инженер М.Г. Бангер представил инициированное Ближневосточным агентством для помощи палестинским беженцам и организации работ (БАПОР/UNWRA) предложение использовать Ярмук для облегчения ситуации с дефицитом воды в Иордании и Сирии, Израиль увязал свое участие в проекте с вопросом признания Государства Израиль арабами. Специальный посланник президента США Эйзенхауэра Эрик Джонсон также не добился успеха в вопросе регионального соглашения по использованию вод, так как Израиль отверг его из-за того, что арабы готовы были принять американский вариант. И, наоборот, когда Сирия и Ливан более не подтверждали свое желание участвовать в этом проекте из-за внутриполитической ситуации, Израиль объявил об условном соглашении. Тактика Израиля заключалась в срыве любых предложений, которые не соответствовали стратегическим интересам государства. Израиль занялся реализацией своего собственного проекта – всеизраильского водопровода, задачей которого было предоставить еврейским иммигрантам воду из арабских стран.
Первым этапом израильского плана было осушение болот Хула в Иорданской долине в 1951 г. Это означало действия в центральной демилитаризованной зоне. Сирия сочла это нарушением договора о прекращении огня и отреагировала военным путем. В том же году Израиль начал полномасштабное строительство всеизраильского водопровода.
Для арабов всеизраильский водопровод стал символом экспансионизма, на который они пытались ответить своими проектами по отклонению истоков рек. Израиль, в свою очередь, считал такие проекты угрозой национальной безопасности и не стеснялся использовать все рычаги давления, включая военную силу. Арабы также использовали военные методы. Первая военная акция Национального фронта освобождения Палестины была совершена против всеизраильского водопровода.
Вода снова оказалась в центре конфликта в середине 1960-х гг., когда арабы запустили проект изменения потоков Иордана (Баниас и Хасбани), которые берут начало на Голанских высотках и в Южном Ливане. Этот проект, решение по которому было принято в 1964 г., стал частью широкой антиизраильской кампании, которая началась после заявления Израиля о неотвратимом запуске всеизраильской водопроводной системы. Технически арабский проект был крайне сложным, так как воду приходилось закачивать на высоту 350 метров; а его экономическая выгода была сомнительной. Очевидно, что этим проектом арабы преследовали исключительно политические цели. Основным «ударом» по Израилю было сокращение количества воды во всеизраильском водопроводе на треть и увеличение содержания соли в Тивериадском озере, что привело бы к коллапсу всей системы водоснабжения Израиля. Израильское руководство предупреждало арабов, что еврейское государство рассматривает непрерывность водоснабжения как жизненно важный государственный интерес. Несколько раз между 1965 и 1967 г. израильские армия и ВВС атаковали стройплощадки, где этот проект воплощался в жизнь. Серия столкновений из-за воды стала прелюдией масштабной Арабо-израильской войны, разразившейся в июне 1967 г. Ариель Шарон как-то отметил: «Люди обычно считают 5 июня 1967 г. датой начала Шестидневной войны. Это официальная дата. Но реально война началась за два с половиной года до этого, когда Израиль решил использовать военную силу как действие против перенаправления Иордана». Его слова подтвердили предсказание Бен-Гуриона, говорившего, что евреи и арабы будут воевать за доступ к водным ресурсам, а последствия этих войн определят будущее Палестины.