Первый полет истребителя состоялся 27 декабря 1942 г или всего через семь месяцев и три недели после первого полета N1K1. Самолет имел фирменное обозначение "экспериментальный сухопутный истребитель модель Х-1". На нем стоял двигатель "Хомаре’’-l 1 мощностью 1820 л.с. Вооружение включало две 20-мм пушки "тип 99 модель 2" на крыле и два фюзеляжных пулемета "тип 97" калибра 7,7-мм. С самого начала испытаний самолет преследовали проблемы с шасси и двигателем - последний никак не выдавал заявленной мощности. Летчик-испытатель отмечал также плохой обзор на рулежке и сильный реактивный момент винта на взлете. Однако в полете самолет хорошо управлялся и практически не уступал в маневренности А6М2 "Рейзену". К июлю 1943 г были готовы четыре опытных самолета, один из которых был передан флоту для испытаний. Первоначально флотские специалисты отнеслись к самолету с предубеждением, зная, что это частная инициатива фирмы, и отмечали, что конструкция самолета неудачна. Характеристики также оказались ниже заявленных - скорость составила только 565 км/ ч вместо планируемой 640 км/ч. Однако скорость была выше, чем у А6М5, к тому же истребитель Каваниси превосходил по маневренности и дальности полета самолет Мицубиси J2M2 - последний был только чуть более быстрым. В результате флот, которому срочно требовался самолет, способный противостоять американским истребителям "Хеллкэт" и "Корсар", указал Каваниси прекратить проектные работы по береговым перехватчикам J3K1 и J6K1, которые создавались по требованиям к истребителям 17-Си и 18-Си, и срочно начать доводить с помощью флотских специалистов сухопутный вариант N1K1. В результате самолет получил обозначение N1K1-J "Сиден" (Фиолетовая молния).
Следующие опытные и предсерийные самолеты, выпущенные в течение 1943 г, были оснащены 1990- сильным двигателем Накадзима NK9H "Хомаре"-21 с новым капотом. Самолет получил еще пару 20-мм пушек "тип 99 модель 2", установленных на крыле. К концу 1943 г завод в Нарио выпустил 17 N1K1-J, а завод в Нимейи выпустил первый серийный самолет, получивший флотское обозначение " морской истребитель перехватчик "Сиден" модель 11".
В Японии началась подготовка пилотов на новый самолет, которая сопровождалась постоянными отказами двигателя и поломками шасси. Однако с началом высадки американцев на Филиппинах 201-й кокутай был перегнан в Себу, где тут же потерял несколько самолетов на земле. Еще несколько машин было потеряно из-за отказа двигателя или поломки шасси. Самолет страдал из-за недостаточной подготовки обслуживающего персонала для работы со сложными системами истребителя. Однако в бою "Сиден" показал себя превосходно - опытные пилоты без труда "обыгрывали" противника, а союзники считали "Сиден" одним из лучших японских самолетов.