9 августа 1946 г. М.Л. Галлай совершил на «Ф-3» первый полет. Вот как он вспоминал о нем: «Скорость разбега нарастает. Поднимаю носовое колесо. Краем глаза вижу, как стрелка указателя скорости подходит к цифре «200». И почти сразу после этого машина отрывается от земли....
Самолёт норовит задрать нос. Допускать этого нельзя, иначе он потеряет скорость и рухнет на землю. Поэтому сразу же энергично отклоняю ручку вперед, от себя. Она, будто живая, сопротивляется этому, но оснований для тревоги пока нет: как известно, усилия можно снять триммером. Даю импульс на снижение усилий, но — что за чудеса! — они не только не уменьшаются, но делаются еще больше. Отношу это за счёт того, что непрерывно растет скорость ия, по-видимому, не успеваю своими действиями за ней. А посему — еще одно, на этот раз более длительное нажатие на тумблер, и... ручка управления лезет на меня с такой силой, что приходится упереться в неё обеими руками и только таким образом удерживать самолёт в повиновении.
Это нелегко, зато теперь по крайней мере ясно, в чем дело: перепутано управление триммером. Конечно, потом, на земле, так оно и оказалось: из-за не очень понятной системы маркировки (к чему относить метки «вверх» и «вниз» — к триммеру или к самому рулю?) контрольный мастер в одной из последних проверок «нашёл дефект» и перепаял концы электрической проводки управления триммером «как надо».
Изловчившись, вороватым движением отрываю левую руку от ручки управления и отклоняю тумблер триммера в обратную сторону. Усилия сразу уменьшаются. Все приходит в норму.
С земли заметили только, что самолёт после отрыва от полосы пошёл в набор высоты немного круче, чем следовало бы. О пикантных подробностях этого этапа полёта я рассказал всем (а особенно красочно — контрольному мастеру по управлению) уже после посадки».
Во время посадки Галлая поджидала еще одна неприятность — сломалась передняя стойка шасси. Произошло это уже в конце пробега, и серьезных повреждений МиГ-9 не получил.
Сборка первой серии истребителей И-300 на заводе № 1 в Куйбышеве
Второй экземпляр МиГ-9 взлетел 11 августа. Этот полет прошел нормально. Последующие полеты показали, что проблема тепловых экранов решена, а на повестке остался только «зуд» от двигателей.
После подтягивания креплений второй самолет стали готовить к участию в параде 18 августа в Тушино, приуроченного ко дню ВВС. Парадный показ прошел успешно. Далее проводились испытания на дальность, в том числе и с одним работающим двигателем. В полете с двумя двигателями на высоте 5000 м и скорости 563 км/ч МиГ-9 показал дальность 633 км. При одном работающем ТРД на скорости 360 км/ч дальность увеличилась на 93 км. На одном двигателе самолет вел себя устойчиво. Во время полетов на скорость удалось разогнаться до 920 км/ч. Высоту в 5000 м истребитель набирал за 4,5 мин. 10 и 17 октября состоялись пробные стрельбы из пушек, которые выявили серьезные проблемы с работой ТРД при попадании пороховых газов в воздухозаборник.