Знаменитый налет на Констанцу 20 августа 1944 года нанес гораздо больше ущерба подводным силам противника, чем все усилия Черноморского флота в предшествующие три года. Было потоплено и повреждено много кораблей и судов. Из подводных лодок «U9» получила прямое попадание и легла на грунт у пирса, а «U18» и «U24» были тяжело повреждены, так же как и находившиеся под румынским контролем «CB-4» и «CB-6». Через пять дней немцы затопили «U18» и «U24», так как было очевидно, что Констанца вот-вот будет занята советскими войсками. Кроме того, Румыния, чтобы избежать полной катастрофы, перешла на сторону СССР.
29 августа при занятии Констанцы в числе прочих кораблей и судов были захвачены румынские подлодки «Марсуинул» и «Рекинул», а также все пять оставшихся «малюток» типа CB. Третья румынская подлодка, «Дельфинул», была захвачена в Дунае.
Три последние немецкие лодки действовали в море вплоть до исчерпания автономности, а потом были затоплены экипажами у турецкого берега. Вопреки распространенным представлениям, они затопились не в одном месте и не в одно время. «U20» пошла ко дну у Карасу 10 сентября в 21:30 (22:30 по Москве), «U23» – у Агвы в тот же день в 23:45 (00:45 11 сентября), а «U19» – 11 сентября в 22:35 (23:35). В этот момент подводная угроза на Черном море исчезла.
Румынские и итальянские подлодки (за исключением «CB-6») были включены в состав Черноморского флота. «U9», «U18» и «U24» подняли и зачислили в списки, но так и не отремонтировали. Итальянские лодки также не стали вводить в строй и в 1945 году исключили. Две румынские лодки были возвращены, а «Марсуинул» 20.02.1945 затонула в Поти от взрыва своих торпед, поднята, но в 1950 году исключена из списков.
Недостроенные немецкие подводные лодки, захваченные в конце войны на верфях
Советской армией на Балтике были захвачены два судостроительных завода, занимавшихся к концу войны постройкой подводных лодок.
1. Завод «Шихау» в Данциге: с ноября 1943 по сентябрь 1944 года здесь были размещены заказы на строительство 184 больших подводных лодок нового поколения (тип XXI). Первые 25 лодок успели сдать флоту, еще 12 в феврале – марте 1945 года отбуксировали для достройки в другие порты. Когда 30 марта Данциг был взят войсками 2-го Белорусского фронта, на стапелях оставались 20 единиц («U3538» – «U3557»), еще для 14 («U3558» – «U3571») были частично заготовлены секции. 13 подлодок («U3538» – «U3550») зачислили в состав КБФ 12.04.45, еще 7 («U3551» – «U3557») – 12.02.46. Они получили обозначения «ТС-5» – «ТС-13», «ТС-15», «ТС-17» – «ТС-19», «ТС-32» – «ТС-3». Хотя некоторые из лодок были захвачены в довольно высокой степени готовности («U3538» – 75 %), ни одну из них так и не достроили.