19 июня по указанию Главного морского штаба ВМФ Балтийский флот был переведен на оперативную готовность № 2[1958]. В своем приказе от 5 июня 1941 г. нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов потребовал от командований флотов «обнаруженные недочеты фактической оперативной готовности корабля, части, соединения флота доносить… как о чрезвычайном происшествии», а также «строго наказывать за случаи притупления внимания и очковтирательские заключения»[1959]. От указанного фактора в тот момент зависело очень многое, и в первую очередь, готовность КБФ к боевым действиям в случае начала войны.
Адмирал флота Советского Союза Н. Г. Кузнецов после войны справедливо заметил в своих мемуарах, что «мы не сделали… всех выводов» из опыта советско-финляндской войны, из-за чего «положение в центральном аппарате мало изменилось к моменту нападения на нас Германии»[1960]. Правда, бывший нарком ВМФ тут же поспешил объяснить и оправдать это тем обстоятельством, что до начала Великой Отечественной войны «времени оставалось мало и кардинально изменить положение оказалось уже невозможным»[1961]. Однако, для того, чтобы что-то исправлять, необходимо ещё определённое желание, а оно у Военного совета КБФ не особенно наблюдалось. Особенно неудовлетворительным оставалось положение с боевым управлением, службой штабов, работой разведки, а также оперативной и тактической подготовкой командного и начальствующего состава, которая в основном находилась на довольно низком уровне. Именно этим объясняются многочисленные просчёты командования, неудачные боевые операции и тяжёлые потери Краснознамённого Балтийского флота в 1941–1942 гг. Последующая боевая деятельность КБФ в 1943-45 гг. также не впечатляла особыми достижениями. Недостатки подготовки мирного времени пришлось исправлять уже непосредственно в ходе боевых действий Великой Отечественной войны, жертвуя при этом обучении немалыми людскими силами и материальными средствами.
Краснознаменный Балтийский флот оказался не в полной мере подготовленным к действиям в составе больших соединений – как в навигационном отношении, так и в плане отработки боевых задач. Основными причинами такого положения были неправильная организация БП на уровне флота в целом и в составе крупных соединений. При прохождении процесса боевой подготовки, как правило, допускалось немало условностей, упрощений. Многие трудные задачи курса БП зачастую пропускались отдельными частями и кораблями ради получения общего благоприятного результата. В итоге, многие учебно-практические мероприятия (маневры, учения), несмотря на всю свою масштабность, имели относительно небольшую практическую значимость. Подготовка ко многим учениям и играм с участием командного состава носила формальный характер, что в значительной мере обесценивало их значение. Отрицательным явлением в БП Советского ВМФ была сезонность, когда большая часть учебных мероприятий приходилась на определенное время года (лето-начало осени). В силу этого, процесс боевой подготовки личного состава флота носил неравномерный, скачкообразный характер. Если к концу каждого года уровень подготовки личного состава повышался за счет проведения учений и маневров, то с начала следующего года приходилось всё начинать сначала.