Однако новые базы в Эстонии и Латвии оказались не готовы к приему большого количества соединений, учреждений и организаций флота, срочно переброшенных туда в период 1939–1940 годов. Командование ВМФ излишне форсировало события в таком ответственном деле, как перебазирование сил флота в новые западные базы, и стремилось как можно быстрее закрепить за собой полученную территорию. Во многих гаванях условия базирования ещё не позволяли в полной мере обеспечивать потребности соединений, частей и кораблей флота.
Сыграла свою роль и некоторая поспешность с решением вопроса о создании главной базы флота, которую вначале стали строить в Палдиски, а впоследствии решили сделать в Таллине. Если учитывать, что одновременно велось строительство большой базы в Усть-Луге, то возникает вопрос о не вполне разумном расходовании средств на создание системы базирования на Балтике. Сильно осложняло ситуацию и неопределенное положение с сухопутной обороной военно-морских баз в бывших республиках Прибалтики. Всё это привело к тому, что Балтийский флот не имел надежного базиса для проведения боевых операций и тем самым ставил себя в весьма трудное положение в случае войны.
5) Уровень подготовки командно-начальствующего состава КБФ в период активного строительства флота и проведения политических репрессий во второй половине 1930-х годов носил в основном недостаточный характер в силу ряда социальных особенностей советского общества и классовой политики, проводившейся в стране.
Прежде всего, необходимо понимать, что командиры, подготовленные в системе ВМУЗ’ов в период 1920-х – 1930-х годов, вовсе не являлись какой-то особенной кастой или элитой советского общества. Не следует думать, что командиры и начальники ВМФ формировались в некоем вакууме, изолированно от всего общества. Наоборот, надо понимать, что люди, которые поступали в военно-морские училища и становились затем командирами флота, были типичными представителями советского общества, они формировались в системе советской командно-административной системы, получали стандартное советское образование и воспитание, что неизбежно накладывало отпечаток на их последующую служебную деятельность. Поэтому требовать от них тех качеств, которые были присущи офицерам Российского императорского флота, вовсе не следует.
Здесь также нужно учитывать ярко выраженный классовый подход советского государства к воспитанию своих управленческих кадров. После Гражданской войны руководство партии и правительства сделало ставку на подготовку будущих командиров для РККА и РККФ по классовому признаку. Причем, особенно сильно это явление наблюдалось в 1920-е годы. Предпочтение при приеме в военные училища тогда отдавалось представителям «социально близких» слоев общества – рабочим, крестьянам, и лишь в последнюю очередь – интеллигенции. Поскольку в командиры стали рекрутироваться представители малообразованных слоев населения, это сразу же привело к резкому понижению общего интеллектуального уровня командно-начальствующего состава Рабоче-Крестьянского Красного Флота по сравнению с офицерами Российского императорского флота.