Помимо ударов по заранее разведанным и назначенным плановым целям, самолеты привлекались для непосредственной поддержки войск и оперативной работы «но вызову» Наиболее практичными оказались авиабомбы разнообразных типов (ФАБ ОФАБ и РБК) и блоки НАР обеспечивавшие поражение целей с безопасных высот и дальностей — крепнущая ПВО противника быстро стала серьезной проблемой для авиации. Обычно применялись бомбы калибров 100, 250 и 500 кг, а нагрузка не превышала 1000-1200 кг из-за трудностей взлета с горных аэродромов в жару, когда разреженный воздух и высокая температура приводили к падению тяги двигателей и снижению несущих характеристик крыла.
Другой проблемой оказалась невысокая эффективность сверхзвуковых истребителей-бомбардировщиков в борьбе с малозаметным противником на местности, отличавшейся от привычных полигонов и мишенных полей. В горах и пустынях, изобилующих естественными укрытиями, поиск противника сам по себе оставался сложной задачей. Обнаружить такую цель с высоты и на большой скорости было проблематично, не всегда результативной оказывалась и помощь наземных авианаводчиков, часто затруднявшихся дать хорошо различимые с воздуха ориентиры. Не подходила для сложного рельефа и автоматика прицелов, вынуждавшая выполнять бомбометание в ручном режиме с невысокой точностью Пушки в таких условиях практически не применялись — рубежи атаки находились за пределами дистанции прицельного огня.
За год работы 217-й апиб потерял один Су-17, не вернувшийся с разведывательного задания. Полк был отозван в Союз и больше участия в афганской кампании не принимал Су-17 с двигателями АЛ-7Ф1 были признаны неудовлетворительными, в первую очередь, по причине недостаточного радиуса действия, а также слабого вооружения и прицельно-навигационного оборудования.
На смену им пришли Су-17M3, которыми оперативно перевооружили несколько полков ТуркВО. Летом 1981 года на самолеты этого типа перешли 136-и апиб из Чирчика и 156-и апиб из Мары-2, летчикам которого пришлось переучиваться с перехватчиков Су-15 (до этого полк был истребительным и входил в авиацию ПВО) В дальнейшем, чередуясь, эти части практически безвылазно занимались «исполнением интернационального долга», действуя как с афганских аэродромов, так и с приграничных баз ТуркВО На подмену им приходили «тройки» 168-го апиб, а в ноябре 1987 года эстафету приняли Су-17М4 274-го апиб из Калинина. В 1988-1989 гг. по Афганистану с аэродрома Кокайды работала и эскадрилья Су- 17М4 302-го апиб.
Богатое прицельно-навигационное оборудование, входившее в ПрНК-54, позволяло использовать «четверки» в качестве самолетов-лидеров: при полетах на удаленные цели в сложных осенне-зимних условиях, когда местность была скрыта туманами и облачностью, они возглавляли ударные группы самолетов МиГ-23 и Су-25, выводя их к целям. Иногда бомбометание выполнялось по данным РСДП, а ведомые сбрасывали бомбы по их сходу на лидере Большинство вылетов Су-17 выполняли с ПТБ-800, которые были необходимы в полетах над сложной в ориентировании местностью.