Главную роль в этих преступлениях сыграла «команда Арайса» – отряд, созданный коллаборантом В. Арайсом из латышей-добровольцев, считавших себя пострадавшими от действий советской власти.
Участники этой группировки носили форму латвийской армии. В качестве отличительного знака арайсовцы имели на рукаве зеленую повязку с изображением черепа скрещенными костями и надписью «Полиция безопасности» на латышском и немецком языках. Впоследствии эта «униформа» была заменена обмундированием по образцу германской армии.
В. Арайс и его ближайший помощник, бывший капитан латвийской армии и известный летчик Г. Цукурс, «прославились» необычайной жестокостью. Изощренным пыткам и издевательствам под их предводительством подвергались даже старики и дети.
Одним из самых известных злодеяний этого боевого формирования стало сожжение рижской Хоральной синагоги на ул. Гоголя, в которой 4 июля находилось около 500 евреев. После избиений и всяческих издевательств людей заперли в здании и подожгли его. Тех, кто пытался выбраться, расстреливали. Это зверское преступление, совершенное без какого бы то ни было приказа немцев, стало символом холокоста в Прибалтийских республиках. Местному населению давался своеобразный знак: отныне евреи находятся вне закона, и любой может поступать с ними как угодно, не опасаясь наказания.
В тот же день отряды «самоохраны» разгромили еще около 20 синагог. Всего погибло более 2000 человек. К 11 июля коллаборационисты убили уже 7000 евреев. Вскоре оккупационные власти взяли деятельность местных погромщиков под свой контроль. Им было предложено вступить во «вспомогательную полицию» (шуцманшафт).
Дальнейшее уничтожение евреев в Прибалтике было возложено вермахтом на айнзатцгруппу «А» под командованием генерал-майора полиции и бригаденфюрера СС В. Шталекера. В. Арайс прошел переподготовку в Берлине, в 1942 году получил звание штурмбаннфюрера и был переведен на восток для борьбы с партизанами и выполнения фронтовых операций. Известно, что он участвовал «в решении еврейского вопроса» в Белоруссии, а также в патрулировании Варшавского гетто. Был награжден крестом «За военные заслуги» с мечами и Железным крестом.
С середины июля начались массовые убийства евреев в провинции. Так, была сформирована сеть «латышских СД» с отделениями в Елгавском районе, Бауске, Тукумсе, Екабпилсе. К концу июля эти группы под руководством М. Вагуланса расстреляли 300 евреев, а в начале августа – более 1500. За 1941 год всего в Латвии было убито около 62 тысяч евреев.
В августе оккупационные власти выпустили «Временные правила по обращению с евреями». В них разграничивались чистокровные евреи и их потомки, а также лица, принявшие иудаизм или состоявшие в браке с евреями. На пребывание и поведение в общественных местах лиц этой национальности, как и вообще на их быт, налагался ряд запретов и ограничений. Евреи должны были носить на одежде шестиконечную желтую звезду. Им запрещалось перемещаться по тротуарам и пользоваться транспортом. Они не допускались на спортивные и культурные мероприятия.