Из Маньчжурии генерал-квартирмейстер расформированной по случаю подписания мирного договора армии возвращался домой по железной дороге. Алексеев, да и не только он один, был поражён размахом революционных беспорядков, которые царили почти по всей линии Транссибирской железнодорожной магистрали.
Ещё в ходе войны в одном из писем супруге он писал о своих чувствах после прочтения во фронтовом «Манчжурском вестнике» сообщения о событиях 9 января 1905 года в российской столице. Речь шла о столкновении войск с «толпой» у Нарвских ворот и Александровского сада:
«Трудно судить по короткой телеграмме, но мне рисуется внутреннее наше положение опасным. Брожение ищет выхода. Этот выход может быть дан мерами предупредительными, но силы накопившиеся могут и не дождаться этих мер, и прервать все преграды, и вылиться в форму, образец которой нам даёт история. Для мирного выхода опять же нужен человек и нужно не упустить время. Но человека нет, а сколько пропущено времени.
Вразуми Бог тех, кому вверена судьба России, пошли им умение вывести на глубокое место её исторический корабль, носящийся ныне между опасных скал без руля, без опытного капитана, без разумных, решительных и смелых лейтенантов.
Я весь теперь двоюсь душой между нашими здесь неважными делами и событиями в России. Опасное, тревожное время в Петербурге, мне страстно бы хотелось быть с тобою и своими малышатами (детей супругов Алексеевых звали Николай, Клавдия и Вера. - А. Ш.).
Нужно, однако, отбывать общую страдную русскую пору так, как складывает это судьба. В общем, действительно тяжёлая година, и переживать её приходится родине без видных деятелей. Можно сказать, что здесь власть и судьба в руках ходульных, мнящих, но не твёрдых, ну, а в Петербурге ты сама знаешь...».
То на одной, то на другой станции, на зданиях вокзалов мелькали красные флаги. Эшелоны с демобилизованными солдатами превращались в неуправляемые воинские команды на колёсах. Среди солдат сновали агитаторы всевозможных социалистических партий. Воинская дисциплина пала в считанные дни, среди солдат было много пьяных. Офицеры и младшие командиры растеряли большую часть своей уставной власти.
На Транссибе, по которому из Маньчжурии в Россию шли десятки и десятки воинских эшелонов, царила революционная анархия. Алексеев смотрел на всё это «безобразие» из окна вагона. В голове мелькала только назойливая и тревожащая ум мысль:
— Смута. Русская смута. Как во время царей Шуйского и Лжедмитрия...
— Что будет завтра с Россией? Погибнет или укрепится после смуты?..