Уже 22 июня специальной директивой наркома внутренних дел и Прокурора Союза ССР Берия было приостановлено (цитирую) "освобождение заключенных, осужденных за измену Родине, шпионаж, террор, диверсию, троцкистов, правых и за
бандитизм". Впоследствии эта директива была дополнена, и до окончания войны задержаны: "иноподданные воюющих с СССР стран и все подданные этих стран, независимо от состава преступления; члены антисоветских политпартий и участники буржуазно-националистических контрреволюционных организаций; граждане СССР национальностей из Бессарабии (до установления там советской власти), осужденные за контрреволюционные преступления". Всего заключенных, отбывших сроки наказания и подпадающих под действие указанных директив, в лагерях и колониях до конца войны задержано было несколько десятков тысяч человек.
"Московская зачистка"
Не позже семи часов утра 22 июня начальником Управления НКГБ по Москве и Московской области комиссаром госбезопасности 3-го ранга Кубаткиным и начальником Управления НКВД по Москве и Московской области старшим майором госбезопасности Журавлевым был уже составлен и введен в действие "План агентурно-оперативных мероприятий УНКГБ и УНКВД г. Москвы и Московской области по обеспечению госбезопасности г. Москвы и области в связи с нападением гитлеровской Германии на СССР". Вот как он выглядел.
"Для обеспечения государственной безопасности г. Москвы и Московской области в связи с начавшимися военными действиями между СССР и Германией провести по УНКГБ и УНКВД г. Москвы и Московской области следующие мероприятия:
1. С 7 час. 00 мин. 22.06.1941 г. весь оперативный состав управлений перевести на казарменное положение.
2. 22.06.1941 г. по отделам, межрайотделам, горотделам и райотделениям просмотреть все имеющиеся агентурные и следственные материалы на лиц, изобличенных в антисоветской и уголовно-преступной деятельности.
Немедленному аресту подлежат:
по признаку "Т" - 71
по признаку "Ц" - 16
по признаку "В" - 8
шпионаж германский - 161
шпионаж итальянский - 6
шпионаж японский - 34
шпионаж другой - 56
по признаку бактериологической диверсии - 8
троцкистов - 78
быв. участников а/с (антисоветских - Э. Б.) политпартий - 82
сектантов-антивоенников - 91
разного а/с (антисоветского. - Э. Б.) элемента - 466
Всего - 1077 (человек)
Кроме того, немедленному изъятию подлежит уголовно-преступный элемент в количестве 230 человек.
3. С 22.06. учащенный прием и инструктаж всей агентурно-осведомительной сети, направив ее на:
а) вскрытие к/р подполья и деятельности иностранных разведок;