Однако у бесланского теракта была еще одна дикая цель. В те страшные дни среди убитых горем людей стали активно распространяться слухи, что среди террористов много ингушей, и в осетинском Беслане вновь вспомнили о конфликте с ингушами в 1992 году. Вооружены здесь все, и достаточно лишь искры, чтобы огонь войны заполыхал по всему Кавказу.
В ночь на 4 сентября 2004 года президент Путин прилетел в Беслан, посетил больницу и отдал указание немедленно перекрыть административные границы Северной Осетии. Власти сделали все для того, чтобы предотвратить новый конфликт. Спустя неделю после кровавого Дня знаний Шамиль Басаев публично взял на себя ответственность за этот теракт.
До сих пор тайна следствия окутывает бесланское дело, обрастая слухами и догадками. С чем следствие определилось сразу, так это с авторами кровавого сценария, которыми оказались Масхадов и Басаев. Спецслужбы России объявили на них охоту.
8 марта 2005 года спецназовцы оцепили поселок Толстой Юрт в 20 км от Грозного. Масхадова выдал один из боевиков, захваченных накануне. Срочно сформирована группа захвата, и дом-бункер, где скрывался Масхадов, окружен. Дальше события развивались следующим образом. Накладным зарядом вход в этот бункер был подорван, в результате чего произошло обрушение части крыши и боковых стен, образовался завал, который не позволил подойти к этому лазу. Но военным удалось запустить в лаз зонд, через который на телеэкране ясно было видно тело лежащего человека.
Так закончилась охота за Масхадовым. Однако невыясненным осталось одно странное обстоятельство: Масхадов погиб от пуль, а не от осколков гранаты или под обломками здания. Считается, что его убил его же охранник.
Неуловимый Шамиль Басаев проживет недолго. Человека, за голову которого ФСБ назначила самую большую премию в истории России в размере 10 миллионов долларов, ликвидируют 10 июля 2006 года.
Возмездие неотвратимо настигло «псов террора».
3 марта 2006 года премьер-министр Украины Юрий Ехануров подписал молдово-украинский протокол о новых таможенных правилах, в соответствии с которыми приднестровские предприятия смогли бы вывозить свою продукцию, только зарегистрировавшись в Кишиневе. Фактически это была экономическая блокада Приднестровья.
Республика оказалась на краю экономической, социальной и политической пропасти. На митинги вышли десятки тысяч жителей, на границах с Молдовой и Украиной выстраивались пикеты. Люди разбивали палатки, на «буржуйках» готовили пищу. Им предстояло отстоять здесь не одну неделю.
Положение дел в республике становилось все серьезней. К середине марта в больницах стал ощущаться дефицит лекарств, в дошкольных учреждениях – нехватка продуктов. Молдова и Украина заявляли о первых успехах нового таможенного режима, а Москва собирала гуманитарный груз.