В западноевропейском обществе ходили легенды о том, что розенкрейцеры не нуждаются в пище, способны превращаться в невидимок и повелевать духами. Сами же члены братства считали, что их цель — овладение утерянными тайнами древней науки, возврат людям невиданного долголетия и наделение монархов сокровищами, которые позволят улучшить долю подданных.
Уверенность в существовании неких магов — членов тайного братства, в руках которых судьбы мира, стала причиной многочисленных обращений к его предполагаемым членам от желающих вступить в орден (письма об этом, причем в немалом количестве, можно найти и в XX веке, например в библиотеке Геттингенского университета). Были и те, кто утверждал, что являются уполномоченными братства.
Однако в истории предполагаемого братства слишком много загадочного, чтобы можно было с уверенностью утверждать, что оно реально, а не легендарно. Если речь идет о действительно существовавшей единой организации, а не, что более вероятно, о группе обществ, не имевших между собой связи, то удивляет сочетание строгой секретности и печатного рекламирования братства. Подлинная же, более поздняя история розенкрейцерства, затемнена многими, порой совершенно противоречивыми легендами, сочиненными с начала XVII века вплоть до конца века XIX.
После 1620 года розенкрейцеры, судя по существенному снижению количества свидетельств, сворачивают свою деятельность. В общем-то, это можно объяснить разразившейся Тридцатилетней войной. Они еще некоторое время продолжают действовать в Нидерландах, а чуть позднее — с 40-х годов XVII века, — видимо, перебираются в Англию, которой война, охватившая материковую Европу, коснулась в меньшей степени. В Англии алхимик Р. Фладд вступает в полемику с теми, кто сомневался в существовании ордена. Участие в братстве (или, как минимум, близость к нему) приписывали великому немецкому философу Готфриду Лейбницу, английскому историку Элиасу Эшмолу, священнику Томасу Вогену. Именно Воген закончил Оксфордский университет и издал под псевдонимом Евгений Филалет труды по алхимии, по сверхчувственному знанию и мистическим тайнам. Т. Воген в 1652 году издает в английском переводе «Весть» и «Исповедь», выражая тем самым полную уверенность в существовании ордена. Хотя, скорее всего, он не знал этого наверняка.
Можно считать достаточно вероятным, что уже в первой половине XVII века иезуиты засылали своих агентов в ряды братства. Первоначально снисходительное отношение высших сановников Католической церкви к ордену достаточно быстро сменяется преследованиями, к которым наверняка приложили руку иезуиты. Так, Адам Хазелмейер, придворный юрист и секретарь эрцгерцога Максимилиана, в 1620 году вместе с другими розенкрейцерами был заподозрен в принадлежности к тайному антипапскому обществу и осужден на пожизненную каторгу как еретик. Орден же объявляется «зловредным обществом магов». Как минимум пятеро розенкрейцеров были повешены в Германии за принадлежность к нему. Кардинал Ришелье в мемуарах писал о «превратных мнениях» розенкрейцеров.