Самым интересным в этом учебном заведении был основной курс. Его программа была создана под влиянием учебной программы ИНХУКа, так как большинство членов ИНХУКа преподавали во Вхутемасе. Оба заведения тесно сотрудничали, так что иногда даже преподаватели приглашали студентов на специальные занятия в мастерские ИНХУКа.
Программа, разработанная В. Кандинским, была построена на объективном изучении основных элементов посредством наблюдения за отдельными видами искусства и их соотношения между собой, а также на изучении искусства в целом. Кандинского глубоко интересовало воздействие различных видов искусства, особенно цвета, на внутренний мир человека. Его мечтой было создать новое синтетическое искусство, которое он называл «монументальным искусством», использующее художественные средства с учетом сравнимости их воздействия на различных людей. Его студенты вспоминали, что мастерская Кандинского была чуть ли не единственной, где можно было работать в своей собственной манере. Его противники, так называемая «молодая» профессура, возглавляемая А. Родченко, интересовались больше «объективным методом», ориентируясь на взаимодействие с архитектурой и скульптурой. На практике этот подход «молодой» профессуры выразился в создании следующих дисциплин: «Максимальное выявление цвета», «Выявление формы цветом» в духе Сезанна, «Одновременность формы и цвета», «Цвет на плоскости», что являлось супрематизмом, и «Конструкция». Согласно некоторым источникам, учебная программа состояла из четырех циклов дисциплин: «цвет», «пространство», «объем», «графика», что соответствовало художественным направлениям того времени: кубизму, кубофутуризму, супрематизму и т. д[191]. Представители «молодой» профессуры глубоко верили в этот пропедевтический курс дисциплин и считали, что таким способом их студенты будут приобщаться к новому искусству. Однако программа была разработана так, что студенты, пройдя пропедевтический курс, шли на специализацию, и таким образом преподаватели их теряли. Именно в этот период были организованы частные занятия в мастерских ИНХУКа и в других местах с тем, чтобы учителя могли продолжать воспитывать студентов, с которыми начали работать. Такой подход противоречил подходу В. Кандинского с его вниманием к личной свободе. Этот момент был крайне важен для о. Софрония в течение всей его последующей жизни.
На основе изучения архивов студентов Свомаса и Вхутемаса видно, что работы, выполнявшиеся в более раннее время, в период с 1918 по 1922 гг., более высокого качества, чем работы студентов последующих лет. Это свидетельствует об обширной экспериментаторской работе, проводимой в те годы. После 1923 года большая часть левых художников вернулась к реализму. Единственным факультетом, который смог полностью сотрудничать и интегрироваться в новую идеологию, был архитектурный факультет.