Постановлением от 14 мая 2015 года № 303 Кабинета Министров утвердил «Положение о структуре НСКС и условиях ее использования для обеспечения безопасности обмена информацией».
НСКС базируется на собственных специальных телекоммуникационных системах и комплексах технических средств, использует ресурсы телекоммуникационной сети спецназначения и в случае необходимости ресурсы телекоммуникационных сетей общего пользования.
НСКС состоит из таких обособленных информационно-телекоммуникационных систем связи:
1) специальная транспортная сеть НСКС, предназначена для транзита трафика между системами НСКС;
2) специальные информационно-телекоммуникационные системы субъектов НСКС;
3) специальная сеть мобильной связи НСКС;
4) специальная информационно-телекоммуникационная система защищенной видеоконференцсвязи НСКС;
5) система защищенного электронного документооборота НСКС;
6) система защищенного доступа государственных органов к Интернету НСКС.
Создание и обеспечение функционирования систем НСКС осуществляется для:
1) обеспечения обмена открытой, служебной и конфиденциальной информацией между субъектами и/или абонентами систем НСКС и ее защиты;
2) создания технологической основы для интеграции распределенных информационных ресурсов в информационных системах, в которых циркулирует открытая и служебная информация органов госвласти и органов местного самоуправления, военных формирований, госорганов, государственных предприятий, учреждений и организаций;
3) обеспечения взаимодействия между информационными системами органов госвласти и органов местного самоуправления, военных формирований, госорганов, государственных предприятий, учреждений и организаций;
4) предоставления ресурса специальной транспортной сети НСКС для обеспечения функционирования специальных информационных систем субъектов НСКС;
5) обеспечения защищенного доступа госорганов к Интернету.
Одним из ключевых элементов НСКС является транспортная сеть. По причине стремительного внедрения интернет — услуг в систему государственного управления, в НСКС появилась отдельная подсистема защищённого доступа государственных органов в интернет.
Важным элементом НСКС также является система защищённого электронного документооборота. В составе этой системы функционирует аккредитованный центр сертификации ключей, служащий для предоставления услуг электронной цифровой подписи в указанной системе.
На базе НСКС развёрнута специальная информационно-телекоммуникационная система защищённой видеосвязи. Решение предназначено для проведения в режиме реального времени служебных совещаний руководителями госорганов.