Однако Мосгорсуд, рассмотрев кассационную жалобу прокуратуры, отменил приговор и вернул дело на новое рассмотрение. В 2006 году Савеловский райсуд прекратил преследование Глушкова по обвинению в хищении за истечением срока давности, а по прочим обвинениям дал ему два года условно.
В январе 2010-го Глушков не без труда получил политическое убежище. Против предоставления убежища выступало британское МВД, которое считало, что Глушков, всю жизнь занимавшийся только бизнесом, не мог подвергаться преследованиям. Однако суд все же предоставил ему убежище на том основании, что конечной целью преследования со стороны российских властей был друг и начальник Глушкова Борис Березовский, и Глушков был арестован, чтобы оказать давление на Березовского, который ранее получил политическое убежище в Англии.
Заочно осужденный в России экс-замглавы «Аэрофлота», бывший соратник Березовского Николай Глушков перед смертью собирался раскрыть детали сотрудничества авиакомпании с российскими спецслужбами, как полагает The Wall Street Journal, и это могло стать одной из причин его убийства.
Об своих намерениях дать подобные показания Глушков, бывший с 1996 по 1999 год заместителем главы «Аэрофлота», рассказывал и своим знакомым. WSJ также ссылается на слова вдовы Александра Литвиненко. Мария Литвиненко заявила, что муж рассказывал ей о связях «Аэрофлота» с российскими спецслужбами и что Глушков также намеревался дать показания по этому поводу.
Глушков не успел дать показания публично, однако WSJ утверждает, что его слова были зафиксированы в судебных документах. По его словам, в 1996 году, после назначения заместителем главы «Аэрофлота», испытывавшего на тот момент проблемы с финансами и устареванием воздушного флота, он решил провести аудит расходов компании. В результате он выяснил, что из 15 тыс. сотрудников «Аэрофлота» 3,5 тыс. были «сотрудниками одной из российских разведывательных структур под прикрытием». Эти показания подтвердила и вдова Литвиненко, заявившая, что, по словам ее мужа, служившего в КГБ и ФСБ с 1988 по 1999 год, «Аэрофлот» был «главным элементом сети российских спецслужб» и еще с советских времен использовался для «транспортировки тайных грузов» и «доставки заработной платы для агентов по всему миру».
Британская полиция расследует смерть Глушкова как убийство. Предприниматель перестал отвечать на звонки своей дочери за день до предварительных слушаний в суде.
Суть дела, по которому собирались допрашивать Глушкова, не уточняется — по словам друзей покойного, он «собирался доказать невиновность» в финансовых махинациях, в которых его обвиняли российские власти.