Судьбоносные споры проистекали по большому счету из противоречий, составляющих имперскую суть Китая и России. На протяжении XVIII столетия власти обеих этих держав в большей или меньшей степени заботились о расширении зоны влияния своих азиатских империй, а также об укреплении контроля над приобретенными землями и покоренными народами. За исключением Сибирского рубежа и возвратного интереса к долине реки Амур, основная инерция русской экспансии направлялась по касательной мимо китайских владений, так как промышленники-московиты, а за ними государственные чиновники с духовенством двинулись на восток и север к Тихому океану. И через него на Аляску. Маньчжурский двор, в свою очередь, на протяжении того века медленно продавливал свое доминирование на запад в Среднюю Азию, то есть в область, где упорные джунгары не собирались без боя сдаваться иноземной гегемонии. Те маньчжурско-джунгарские войны служили фоном для возникновения российско-китайских противоречий. Ведь из-за вооруженных столкновений резко увеличился поток перебежчиков и дезертиров, хлынувший через границу из Монголии в Сибирь. Одной из самых острых и деликатных проблем, разделивших две державы, считается возвращение беглецов из Поднебесной снова на родину.
После нескольких лет затишья джунгарские войны в 1729 году вспыхнули с новой силой. Двумя годами раньше предводитель джунгар Цэван-Рабдан сложил голову в долине реки Или, и его сыну Галдан-Цэрэну достался титул контайши (хунтайчжи). Мандарины цинского двора послали на запад две армии, одну в Алтайский край и другую в Баркуль. Несмотря на то что Галдан послал к императору Юнчжэну своего представителя, в 1731 году этот вождь джунгар начал внезапное наступление на северную армию маньчжуров и наголову ее разгромил. Разрозненные вооруженные стычки случались на протяжении четырех лет, пока войско Галдан-Цэрэна не ослабло, тогда сам он попросил о мире и его получил. После 1735 года еще 10 лет в Китайском Туркестане преобладал непрочный мир, омрачавшийся натиском джунгар с запада на казахов, чуть раньше присягнувших на верность царице Анне Иоанновне в 1734 и 1740 годах. После кончины Галдан-Цэрэна в 1745 году его сын и преемник Цэван Дорджи сразу же проявил жестокость к маньчжурам, но его убил один из собственных братьев. С тех пор до 1758 года на территории Средней Азии практически непрерывно происходили вооруженные схватки и волнения.
Сразу же после подписания Кяхтинского договора началась проверка его на прочность в условиях постоянного нарушения спокойствия из-за вспышек вооруженного противостояния не только между маньчжурами и джунгарами, но также между теми же джунгарами и остальными соседними монгольскими народностями. Для обеих сторон главная функция этого договора состояла в определении линии известной границы между российскими и маньчжурскими территориями; организации ее патрулирования, перехвата всех местных жителей, пытающихся ее пересечь по какой-либо причине, и незамедлительного возвращения их на родину. О многотрудности данной задачи уже говорилось, когда речь шла о контрабандных потоках товара. Коренные жители приграничного района, как сибиряки, так и монголы, относились к традиционно кочевым народам. В отсутствие переписи и прочих способов проверки принадлежности населения русский и маньчжуро-китайский чиновник или солдат зачастую просто не мог найти различия между сибирским бурятом и монголом из тушету-ханства. Куда проще было разобраться с массами народа. Зато толпу кочевников было гораздо труднее убедить вернуться на территорию своей империи, когда все они были при оружии и готовы были его применить.