Введение системы оперативного командования вместо старой системы военных округов проходило тяжело, но Зинченко действовал нахрапом. Разве он мог сказать этим героям гражданской войны и многоуважаемым генералам, что вся эта муть с оперативным командованием была задумана только с одной целью. И цель эта проста как мир, после расформирования военных округов куча генералов останется без должностей, а для назначения на новые должности в штабах групп оперативного командования им потребуется пройти аттестацию. И многие, очень многие красные командармы её не пройдут. Некоторые после аттестации соглашались на нижестоящие должности, некоторые целый месяц обивали пороги высоких кабинетов в Москве, засыпая ЦК партии жалобами, но никаких указаний или грозных окриков от Сталина Зинченко так и не услышал, поэтому продолжал настойчиво создавать новую Красную армию. Изменения начались с самых низов от взводов и рот до самого святого до командования армиями. К маю 1939 года удалось продавить новую штатную структуру армейских корпусов и собрать эти корпуса в оперативные армейские группы.
Все имеющиеся дивизии начали переформировываться под новые штаты. В основном старались увеличить количество пулеметов, противотанковых и зенитных средств в стрелковых батальонах и полках. Каждый батальон получил по артиллерийской батареи в составе четырех 45 мм противотанковых орудий, четырех 40 мм автоматических гранатометов и четырех 82 мм минометов. Кроме того в составе каждого батальона появились артиллерийско-зенитные батареи в количестве трех спаренных 23 мм зенитных установок.
В штаты полков были добавлены дивизионы самоходных 122 мм артустановок и дивизион 120 мм буксируемых минометов.
Теперь общий состав стрелковой дивизии нового штата составил 10800 человек. Число личного состава было уменьшено почти на 7 тысяч человек, при этом количество противотанковых и зенитных средств, артиллерии и пулеметов в дивизиях нового штата была увеличена в двое. И таких стрелковых дивизий нового штата планировалось до конца 1939 года сформировать аж 40, а к концу 1940 — 160 дивизий.
Вместо танковых дивизий предусматривалось формирование танковых бригад и механизированных корпусов.
Началась поставка нового оружия, при чем Зинченко настоял, чтобы новым оружием комплектовались целиком штатные бригады. То есть вооружение не распылять по пять пулеметов на каждую дивизию в военном округе, как это было раньше, а всё новое оружие, передать в один полк для полного его перевооружения, после чего происходило перевооружение следующего полка и так далее пока не будет перевооружена вся дивизия или армия одного стратегического направления, а далее начиналось перевооружение частей другого стратегического направления.