В 1972 г. была переоборудована одна машина. Летные испытания показали улучшение некоторых характеристик самолета. Серийно не строился.
Ан-12БКТ (1972 г.) - топливозаправщик самолетов фронтовой авиации на полевых аэродромах. Внутри грузовой кабины Установлены емкости общим объемом 19 500 л, что позволяет заправить одновременно два истребителя в течение 30...40 мин.
Ан-12Б (изделие "93Т") - летающая лаборатория для метрологического обслуживания и проверки контрольно-измерительной аппаратуры в частях ВВС. В 1972 г. был оборудован один самолет.
Ан-12Б (ЛИАТ - лаборатория исследования авиационной техники) - специальный самолет для проведения работ по определению технического состояния авиационной техники в авиачастях и на местах летных происшествий. Самолет имеет лабораторный отсек как внутри фюзеляжа, так и вне его (палатка-полог) и дополнительное бытовое оборудование. В 1972 г. был оборудован один самолет.
Ан-12БСМ (1973 г.) - самолет-контейнеровоз для гражданской авиации, который может перевозить восемь поддонов ПА-2,5 или восемь контейнеров УАК-2,5, или четыре поддона ПА-5,6, или четыре контейнера УКА-5А. Грузовая кабина самолета оснащена двумя кран-балками общей грузоподъемностью 5000 кг и роликовыми дорожками.
Ан-12БКК "Капсула" (оперативный командный пункт) - самолет-салон для командующего военно-транспортной авиацией. В грузовой кабине размещается легкосъемная гермокабина (капсула) на 20 человек, которая для обеспечения жизнедеятельности в ней подключена к самолетным системам. В 1975 г. был переоборудован один самолет.
Ан-12БК-ИС - модификация Ан-12БК, оснащенная аппаратурой индивидуальной защиты (самого самолета-помехоносителя) от радиотехнических средств ПВО противника. На самолете размещены следующие средства радиоэлектронного противодействия: четыре станции ответных помех "Сирень" в контейнерах на внешней подвеске в носовой и хвостовой частях фюзеляжа; станция активных шумовых помех; устройства создания пассивных и инфракрасных помех.
В 1970 г. переоборудованы 45 самолетов. Ан-12ПП (постановщик помех) - специальный вариант на базе серийных самолетов Ан-12Б/12БК, предназначенный для решения следующих задач: скрывания направления полета, состава и построения подразделений военно-транспортной авиации; создания помех работе РЛС ЗРК, самолетов-перехватчиков, головкам самонаведения ракет (в том числе тепловым), сетям радио- и радиорелейной связи противника; наращивания помеховой обстановки в глубине территории противника и срыва прицельного огня средств ПВО. Самолет оснащен средствами радиоэлектронного противодействия, которые подразделяются на две группы: средства групповой защиты для прикрытия подразделений самолетов и средства индивидуальной защиты для самого самолета-помехоносителя.