В 1966 г. самолеты-амфибии Бе-12 (ПЛО) вышли на боевое дежурство и взяли под контроль просторы ближней зоны противолодочной обороны. 29 ноября 1968 г. был подписан приказ министра обороны о принятии их на вооружение ВМФ СССР.
Самолеты Бе-12 строились серийно на Таганрогском авиационном заводе (ныне АО "Таганрогская авиация") с 1963 по 1973 г. Всего кроме двух опытных самолетов были построены 140 машин. На Бе-12 были установлены 42 мировых рекорда.
Для повышения боеспособности на самолете-амфибии Бе-12 постоянно совершенствовалось оборудование и вооружение. Например, в 1963-1964 гг. прошли испытания самолеты Бе-12ФС (изделие "ЕФС") с двигателями АИ-20ДК, а также Бе-12СК (изделие "ЕСК"), в состав вооружения которого вошел спецбоеприпас. В 1970-х гг. существенной модернизации подвергалась поисково-прицельная система (ППС). Переоборудованным серийным самолетам с усовершенствованной ППС было присвоено обозначение Бе-12Н. В состав усовершенствованного ППС вошли: доработанная РЛС "Инициатива-2БН", многоканальное унифицированное устройство "Нара", прицельно-вычислительное устройство "Нарцисс" с анализатором цели, авиационный магнитометр АМП-73С. Дополнительно к буям РГМ-НМ на самолет стали подвешивать десять пассивных направленных буев РГБ-2.
Списанный со службы самолет Бе-12 одной из первых серий установлен в музее ВВС в Монине.
Поисково-спасательный самолет-амфибия Бе-14
С самого начала работ по Бе-12 предусматривалось создание на его базе специализированного самолета, предназначенного для проведения поисково-спасательных операций в открытом море. Согласно выданным в декабре 1960 г. техническим требованиям самолет, получивший обозначение Бе-12 ПС (или Бе-14), предназначался для поиска экипажей самолетов и кораблей, потерпевших аварию в открытом море, как днем, так и ночью, в простых и сложных метеоусловиях.
Использование самолета-амфибии для спасательных работ на воде давало много преимуществ. Он мог приводниться в районе бедствия, взять на борт пострадавших, оказать им первую медицинскую помощь и срочно эвакуировать на сушу. Сухопутному самолету такая работа была недоступна, он мог лишь сбросить пострадавшим спасательные средства.
В отличие от базового самолета на самолете Бе-14 почти все отсеки лодки были переоборудованы для размещения спасенных людей и оказания им первой медицинской помощи. Самолет мог брать на борт до 33 эвакуируемых человек. Прием пострадавших мог осуществляться через спасательные люки по обоим бортам лодки. В состав экипажа дополнительно были включены бортврач и борттехник.