В дальнейшем беды Владимира не прекратились, его грабили в процессе удельных распрей и набегов ордынцев. Но выгодное экономико-географическое положение всегда способствовало восстановлению города.
Владимир сильно пострадал в период Смутного времени (начало ХVII в.); тогда владимирцы результативно участвовали в первом и втором земских (народных) ополчениях.
Административный статус Владимира менялся: в 1719 г. он стал центром провинции, в 1778 г. – центром Владимиро-Костромского наместничества, с 1796 г. – губернии, при советской власти с 1929 г. он стал районным центром Ивановской области, а с 1944 г. является областным центром Владимирской области Российской Федерации.
Ощутимое промышленное развитие началось на Владимирской земле – тогда Владимирской губернии – с конца XVIII в. когда были построены первые относительно крупные для того времени металлургические и стекольные заводы, а также текстильные фабрики. Тогда возникли крупные фабрично-заводские центры, в том числе и Гусь-Хрустальный. Существенное оживление экономической жизни наметилось во Владимире со второй половины ХIХ в., когда через него в 1858—1862 гг. была проложена Московско-Нижегородская железная дорога. В царской России Владимирская губерния стала одной из наиболее развитых в промышленном отношении. По количеству промышленных рабочих она занимала в начале ХХ в. одно из первых мест в стране. Но это было однобокое промышленное развитие: текстильная промышленность давала 80 % всей фабричной продукции. Владимирскую губернию называли «ситцевым краем». При этом во Владимире крупных предприятий фактически не было, поскольку губернские власти не разрешали строить в нем фабрики и заводы, чтобы не увеличивать число пролетариата, склонного к участию в революционных беспорядках. В начале ХХ в. во Владимире были свечной завод и небольшая текстильная фабрика.
С усилением хозяйственного потенциала несколько ускорилась градостроительная деятельность во Владимире и улучшилось его благоустройство. С учреждением Владимирского наместничества, затем губернии город получил новый «прожектированный» план. После 1785 г. были построены многие новые каменные строения: Присутственные места (здание для губернской администрации), Дом приказа общественного призрения, почтовая контора, Инвалидный дом, Дворянское собрание, Губернаторский дом, мужская гимназия, частные каменные жилые дома, другие здания. В 1860е годы во Владимире появился водопровод, в 1887 г. – телефон, 1909 г. – электростанция. Построили Мальцевское ремесленное училище (1886), церковь Архангела Михаила (1893), здание банка (1896), Исторический музей (1901), Народный дом (1905), Реальное училище (1907), здание Городской думы (1907), старообрядческую Троицкую церковь (1916) и др. Постепенно Владимир превращался в благоустроенный по тем временам и привлекательный губернский город, сохранивший величие старины и обаяние исторического ландшафта.