Пошехонье традиционно славилось своими крестьянскими мятежами, направленными против советской власти. К июлю 1919 года здесь скопилось около 5 тысяч вооруженных крестьян. Дело дошло до того, что повстанцы снова двинулись на Пошехонье, намереваясь захватить город, что им не удалось сделать летом 1918 года. В сторону Похешонья были посланы регулярные части, в том числе артбатарея из двух орудий из Рыбинска. У деревни Михалково произошло ожесточенное столкновение красных с отрядами крестьянских повстанцев. Около села Пречистое восставшие были окончательно разбиты, их общие потери составили около 500 человек убитыми и ранеными. Одним из руководителей восставших был бывший генерал Майер, которого красные пленили и расстреляли. Одновременно с этим была дестабилизирована обстановка в Даниловском и Любимском уездах. Здесь действовали разрозненные группировки, общая численность которых составляла до восьми тысяч человек. Наиболее крупные отряды возглавляли бывшие офицеры братья Озеровы и Пашков. Отряды действовали в местных краях вплоть до 20-х годов, а их предводители превратились в фольклорные фигуры, которые обросли легендами. Разгромить отряд братьев Озеровых удалось только в 1925 году.
Мятеж и его последствия постепенно ушли в прошлое. Теперь предстояло восстанавливать истерзанный и разбитый город, точнее – фактически создавать его заново. Разумеется, что именно делать, большевистское руководство не знало, но оно стопроцентно было уверено, что все должно базироваться на основе самых современных принципов градостроения. «Управление обращается к своему ближайшему руководящему представителю власти – комитету Государственных Сооружений с прямой просьбой дать для предпринятого дела общие директивы и необходимые специальные конкретные указания для идейного обоснования и проведения в жизнь всей программы научных, художественных и технических работ, предпринятых Управлением, имеющих кроме технической задачи и высокую социально-политическую цель: создание первого совершенного образцового социалистического города с коммунистическим обоснованием всей жизни обывателей и всего городского хозяйства… В области градостроительства у нас вообще не было не только каких либо проектов готовых, но даже отсутствовали какие-либо предложения. Воссоздание Ярославля является первой попыткой разрешить силами государства проблему коммунального градостроительства, создание города на новых социалистических началах… В новом городе всё должно быть направлено для удовлетворения и улучшения условий жизни трудящихся масс… Влияние жилищного вопроса на человека сказывается на физической стороне организма, а также в еще гораздо большей степени на его духовной и моральной стороне… Вместо города Ярославля, мрачного и хаотичного, создадим новый город будущего, радостный и гармоничный…»