Юдофобия имеет глубокие исторические корни. Еще греко-египетский общественный деятель Апион Александрийский (25 г. до н. э. — 47 г. н. э.) юдофобствовал о происхождении празднования евреями субботы: «Cовершив шестидневный переход, иудеи заболели бубонами и по этой причине, благополучно достигнув страны, стали на седьмой день отдыхать, назвав этот день «саббатос», потому что заболевание бубонами египтяне называют «саббатозис».
А вот еще один «шедевр» греческого юдофобского мифа (середина III века): «Почему масло так дорого? Из-за евреев! Евреи пожирают в субботу всё, что они вырабатывают в будни, у них не остается даже дров для приготовления кушаний; они должны поэтому сжечь свои кровати; не имея кроватей, они спят на полу, валяясь в пыли; чтобы удалить грязь, им нужно много масла, и поэтому масло так дорого».
В Кёльнском соборе с его богатой художественной отделкой от глаз общественности скрыт деревянный рельеф на хорах начала XIV века, демонстрирующий юдофобскую политику христианства того времени. На рельефе изображена «еврейская свинья» — мотив из одной средневековой легенды: после того как фарисеи спросили Христа о скрывающейся со своими детьми женщине, она превратилась в свинью с поросятами. Этот и подобные ему антисемитские рассказы в христианском средневековье столетиями передавались от поколения к поколению, рождая юдофобские мифы.
Юдофобия была востребована. Населению, недовольному плохими условиями жизни и не понимающему причин своих бед, требовался козел отпущения и они находили его в лице евреев. Особенно юдофобствовала Церковь. Население верило клеветническим вымыслам Церкви, ибо было неграмотно.
«Кровавый навет». Одна из форм юдофобии — «кровавый навет». В 1144 г. в лесу неподалеку от городка Норидж на востоке Англии был найден окровавленный труп заколотого кинжалом 12-летнего подростка. Обвинили в этом местных евреев: якобы они убили мальчика с целью воспроизвести распятие Христа. Начиная с XVI века «кровавый навет» на евреев начал широко распространяться в Восточной Европе. Несмотря на отсутствие доказательств и многократные опровержения обвинений, «кровавый навет» нередко приводил к еврейским погромам.
В 1447 г. Папа римский Николай V запретил возводить клевету на евреев. В булле о евреях он писал: «Чтобы легче возбудить ненависть христиан к евреям, некоторые позволили себе ложно утверждать и убеждать христиан, будто евреи не могут справлять и не справляют празднеств без печени или сердца христианина. Этим неизменным нашим определением мы запрещаем навсегда и самым строгим образом всем верующим во Христе, самим или через других, открыто или тайно, посредственно или непосредственно предпринимать что-нибудь подобное против евреев вообще или против отдельного еврея». Несмотря на запрет Папы, юдофобы продолжали злобствовать.